More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1890 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4108  aminotransferase class-III  77.67 
 
 		 416 aa  651    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.443698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1890  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 415 aa  849    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3515  aminotransferase class-III  92.53 
 
 		 415 aa  797    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.54229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3681  aminotransferase class-III  76.7 
 
 		 416 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232958  hitchhiker  0.000511444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1756  aminotransferase class-III  76.94 
 
 		 416 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00824203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3382  aminotransferase class-III  75.49 
 
 		 414 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0893  aminotransferase class-III  58.39 
 
 		 423 aa  497  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  45.65 
 
 		 434 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  46.67 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  46.15 
 
 		 426 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  44.12 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  45.9 
 
 		 426 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  42.58 
 
 		 426 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  42.58 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  46.7 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  41.98 
 
 		 425 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  42.45 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  42.45 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  42.45 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  42.01 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  42.01 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  45.32 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  42.72 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  44.69 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  42.34 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  45.29 
 
 		 419 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  42.34 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  42.21 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  46.73 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  42.61 
 
 		 426 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  44.81 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  42.61 
 
 		 426 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  44.92 
 
 		 446 aa  348  7e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  44.81 
 
 		 427 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  42.75 
 
 		 430 aa  348  9e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  44.5 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  44.81 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  42.68 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  42.82 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  43.69 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  44.69 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  42.68 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  42.21 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  41.79 
 
 		 427 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  45.86 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  45.84 
 
 		 440 aa  342  8e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  41.79 
 
 		 427 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  44.85 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  42.46 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  41.81 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  44.3 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  41.48 
 
 		 425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  43.78 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  42.71 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  42.78 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  45.37 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  43.63 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  44.12 
 
 		 426 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  42.07 
 
 		 430 aa  328  9e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5663  4-aminobutyrate aminotransferase  42.96 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4211  4-aminobutyrate aminotransferase  43.65 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  41.77 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  44.75 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  44.05 
 
 		 429 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  42.01 
 
 		 426 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  43.58 
 
 		 426 aa  325  9e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  43 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  43.41 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  44.36 
 
 		 427 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  43.54 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  42.13 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  43.94 
 
 		 421 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  41.89 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  42.13 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  42.37 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0047  4-aminobutyrate aminotransferase  45.32 
 
 		 425 aa  318  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  41.77 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  44.94 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4286  4-aminobutyrate aminotransferase  44.02 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.012329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2341  4-aminobutyrate aminotransferase  43.52 
 
 		 423 aa  316  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  45.38 
 
 		 426 aa  316  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  44.92 
 
 		 433 aa  315  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2119  4-aminobutyrate aminotransferase  42.53 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0494  4-aminobutyrate transaminase  43.04 
 
 		 427 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  44.36 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1114  4-aminobutyrate aminotransferase  42.26 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1480  4-aminobutyrate aminotransferase  42.78 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1172  4-aminobutyrate aminotransferase  42.26 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.408586  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A0810  4-aminobutyrate transaminase  42.78 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.622888  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_1205  4-aminobutyrate aminotransferase  42.26 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.60622  normal  1 
 
 
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NC_008835  BMA10229_2127  4-aminobutyrate transaminase  42.78 
 
 		 427 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_0952  4-aminobutyrate aminotransferase  41.03 
 
 		 425 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1822  4-aminobutyrate transaminase  42.53 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0396  4-aminobutyrate transaminase  42.53 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.925328  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  40.73 
 
 		 425 aa  311  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  41.22 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
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