More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66961 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_66961  succinate--CoA ligase (GDP-forming) beta chain (LSC2)  100 
 
 
414 aa  842    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07000  succinyl-CoA synthetase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04520)  63.97 
 
 
440 aa  536  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0570406  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07260  succinate-CoA ligase (ADP-forming), putative  57.89 
 
 
418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.65 
 
 
397 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.65 
 
 
397 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.4 
 
 
397 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.15 
 
 
397 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.52 
 
 
393 aa  384  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000861995  hitchhiker  0.0000000000000037897 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26921  beta chain succinyl-coa synthetase synthetase  47.41 
 
 
443 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0876127  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.15 
 
 
397 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31367  predicted protein  48.46 
 
 
420 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187629  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4233  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.36 
 
 
393 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.510138  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.74 
 
 
399 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.13 
 
 
397 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
397 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.59 
 
 
386 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
426 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.85 
 
 
386 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.62 
 
 
386 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.49 
 
 
410 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1855  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.74 
 
 
398 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1926  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.74 
 
 
398 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.97 
 
 
389 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.1 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.36 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.1 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  48.35 
 
 
399 aa  361  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.1 
 
 
386 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.1 
 
 
386 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.1 
 
 
386 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.1 
 
 
386 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.98 
 
 
398 aa  360  3e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.98 
 
 
390 aa  360  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.85 
 
 
386 aa  359  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.72 
 
 
398 aa  358  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.85 
 
 
386 aa  358  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.49 
 
 
398 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.1 
 
 
398 aa  356  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.73 
 
 
392 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.84 
 
 
399 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.21 
 
 
391 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3197  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
399 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.72 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.34 
 
 
403 aa  352  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3396  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.47 
 
 
397 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2162  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.72 
 
 
398 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.08 
 
 
384 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.96 
 
 
389 aa  350  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.7 
 
 
400 aa  349  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.57 
 
 
388 aa  348  8e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4127  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.96 
 
 
398 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1124  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.96 
 
 
398 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.58 
 
 
399 aa  346  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.94 
 
 
398 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.45 
 
 
398 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.11 
 
 
398 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.87 
 
 
383 aa  343  2e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.45 
 
 
398 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.68 
 
 
392 aa  343  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.45 
 
 
398 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3398  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.29 
 
 
404 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.694638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.34 
 
 
407 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.7 
 
 
398 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.07 
 
 
398 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.45 
 
 
399 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.7 
 
 
391 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.8 
 
 
388 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.76 
 
 
387 aa  341  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.37 
 
 
392 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.8 
 
 
388 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.55 
 
 
391 aa  339  5e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.01 
 
 
386 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.01 
 
 
386 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.79 
 
 
389 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  46.02 
 
 
388 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.81 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2406  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.15 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.502778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.54 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.07 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.25 
 
 
385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.17 
 
 
388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.82 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3164  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.69 
 
 
389 aa  335  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.768074  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
389 aa  335  7e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.8 
 
 
391 aa  335  7e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  46.04 
 
 
390 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.38 
 
 
389 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.67 
 
 
388 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.67 
 
 
388 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.54 
 
 
388 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0251  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.94 
 
 
392 aa  334  2e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3973  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.21 
 
 
397 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.18 
 
 
389 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.640254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.12 
 
 
388 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3605  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.41 
 
 
410 aa  333  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194047  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  43.33 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  45.52 
 
 
390 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  45.52 
 
 
390 aa  332  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.27 
 
 
387 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.77 
 
 
398 aa  331  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>