More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60062 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_47451  multidrug resistance protein 4  71.75 
 
 
581 aa  832    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000199475  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60062  spermidine exporter, MDR-type pump  100 
 
 
577 aa  1191    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105172  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53777  Putative transporter C530  55.67 
 
 
659 aa  684    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11120  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03040)  41.74 
 
 
608 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0161613 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06942  conserved hypothetical protein  39.3 
 
 
517 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02675  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01120)  40.35 
 
 
487 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.717308 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06477  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01930)  35.38 
 
 
543 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0082392 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02613  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00230)  37.8 
 
 
506 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.774047 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08610  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
456 aa  295  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00739  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16320)  33.69 
 
 
486 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10152  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04900)  37.13 
 
 
479 aa  290  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00732  Putative multidrug resistance proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5DQ91]  34.87 
 
 
592 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911456  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00290  multiple drug resistance protein, putative  33.33 
 
 
636 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85553  Putative transporter  31.77 
 
 
601 aa  257  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00270  multiple drug resistance protein, putative  33.27 
 
 
642 aa  256  8e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01070  polyamine transport-related protein, putative  34.54 
 
 
752 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.593333  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08122  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02700)  30.86 
 
 
532 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07972  conserved hypothetical protein  35.88 
 
 
454 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0939486 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00100  multidrug transporter, putative  29.37 
 
 
653 aa  248  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.578905  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04119  conserved hypothetical protein  34.97 
 
 
494 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08083  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01350)  31.07 
 
 
560 aa  246  9e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07295  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16860)  30.87 
 
 
544 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.30321  normal  0.0432788 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53101  multidrug resistance protein 7  29.49 
 
 
546 aa  244  3.9999999999999997e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63750  multidrug resistance protein 6 benomyl/methotrexate resistance protein  28.21 
 
 
547 aa  240  5.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.439145  normal  0.0180876 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04313  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06050)  31.56 
 
 
578 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160209  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84561  Synaptic vesicle transporter SVOP  29.4 
 
 
604 aa  236  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58217  multidrug resistance protein 2  28.4 
 
 
540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0156255 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46042  multidrug resistance protein 10  31.64 
 
 
510 aa  233  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59685  multidrug resistance  28.21 
 
 
537 aa  231  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05329  conserved hypothetical protein  31.99 
 
 
490 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03270  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01890)  31.69 
 
 
546 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314909 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50953  Polyamine transport protein (TPO4)  31.76 
 
 
488 aa  221  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00584761  normal  0.988628 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05220  membrane transport protein, putative  32.56 
 
 
595 aa  219  8.999999999999998e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06451  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 
529 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01243  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10370)  31.01 
 
 
551 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43743  multidrug resistance protein 3  32.21 
 
 
592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500194  normal  0.0710927 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08993  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
903 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574507  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08089  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 
525 aa  206  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0159266  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04241  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06440)  32.23 
 
 
416 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.719625 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01330  polyamine transport-related protein, putative  29.47 
 
 
556 aa  203  8e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02210  spermine transporter, putative  28.7 
 
 
528 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00540  hypothetical protein  30.11 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00498  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02060)  26.82 
 
 
545 aa  196  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08621  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02780)  28.48 
 
 
542 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01450  conserved hypothetical protein  30.02 
 
 
509 aa  187  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01860  SCR1 protein, putative  28.91 
 
 
513 aa  186  8e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07779  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.42969 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03985  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00420)  28.66 
 
 
487 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07466  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05840)  31.59 
 
 
476 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01250  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 
515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00370  polyamine transporter, putative  29.6 
 
 
524 aa  179  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00547  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 
372 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284157  normal  0.57711 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00030  multidrug transporter, putative  30.86 
 
 
468 aa  179  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.678764  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04090  MSF transporter, putative  28.7 
 
 
601 aa  177  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0723621  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05369  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00070  drug transporter, putative  27.49 
 
 
644 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41112  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00970  ORF Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79030]  29.44 
 
 
475 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05540  conserved hypothetical protein similar to fructose transporter (Eurofung)  28.13 
 
 
551 aa  165  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05656  MFS multidrug resistance transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13660)  26.8 
 
 
568 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.481984 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07796  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 
335 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.194982 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10013  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17730)  26.11 
 
 
504 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00390  multidrug transporter, putative  28.64 
 
 
563 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.177552  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10062  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 
504 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.168014 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10036  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 
586 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06277  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12550)  26.45 
 
 
607 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82843  member of major facilitator superfamily multidrug-resistance protein  24.81 
 
 
656 aa  139  8.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.451266  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01691  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.02998  normal  0.0975408 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02707  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 
478 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02841  conserved hypothetical protein  25.43 
 
 
500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0134207 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03398  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17680)  25.65 
 
 
559 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.448234 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05559  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11780)  27.02 
 
 
471 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07070  dityrosine transporter, putative  25.45 
 
 
640 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29843  dityrosine transporter A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  26.05 
 
 
469 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.323867  normal  0.166066 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07390  conserved hypothetical protein  21.58 
 
 
552 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08077  multidrug efflux pump of plasma membrane (Eurofung)  23.31 
 
 
552 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.040655 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07936  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01520)  24.59 
 
 
504 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03580  conserved hypothetical protein  23.52 
 
 
633 aa  114  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0622174  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  22.22 
 
 
549 aa  107  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00489  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13830)  24.78 
 
 
552 aa  106  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06774  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11760)  25.42 
 
 
457 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0399317  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06928  conserved hypothetical protein  24.57 
 
 
511 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06063  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08910)  24.17 
 
 
479 aa  103  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64182  putative ion transporter similar to the major facilitator superfamily  20.52 
 
 
547 aa  99  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08911  conserved hypothetical protein  22.62 
 
 
489 aa  98.2  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08983  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02040)  22.87 
 
 
561 aa  98.6  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10207  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04702)  22.77 
 
 
573 aa  98.6  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.38 
 
 
399 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.38 
 
 
399 aa  98.2  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.38 
 
 
401 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.01 
 
 
396 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04840  conserved hypothetical protein  23.47 
 
 
466 aa  97.8  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10958  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05350)  23.31 
 
 
502 aa  97.8  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31127  major facilitator superfamily multidrug-resistance protein  25.23 
 
 
489 aa  97.4  7e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00332  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 
523 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.89 
 
 
430 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.03 
 
 
416 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06019  conserved hypothetical protein  22.6 
 
 
483 aa  95.5  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00615305 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60920  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance multidrug resistance transporter  30.13 
 
 
569 aa  94  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00174903  normal  0.758845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.9 
 
 
526 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06418  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17840)  23.19 
 
 
546 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>