More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42651 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_42651  Mitochondrial GTPase 2  100 
 
 		 488 aa  1003    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00889  GTP-binding protein Obg (AFU_orthologue; AFUA_1G15500)  33.53 
 
 		 555 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.634559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.12 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.7 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  38.43 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  40.67 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  39.91 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  38.89 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  36.64 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  39.3 
 
 		 338 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05610  essential conserved GTPase, putative  29.1 
 
 		 525 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.19 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  39.42 
 
 		 394 aa  154  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  43.68 
 
 		 337 aa  154  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.27 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  41.26 
 
 		 337 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  40.08 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.32 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.27 
 
 		 426 aa  151  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.17 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  43.18 
 
 		 333 aa  151  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  38.84 
 
 		 366 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.36 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  38.43 
 
 		 338 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  41.87 
 
 		 433 aa  150  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  39.82 
 
 		 329 aa  150  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  41.75 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  40.53 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  40.43 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  39.04 
 
 		 343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  38.18 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.63 
 
 		 368 aa  148  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  45.09 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.22 
 
 		 437 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  35.68 
 
 		 439 aa  148  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  40.09 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  37.55 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  38.53 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  39.49 
 
 		 382 aa  147  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  38.77 
 
 		 338 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  37.22 
 
 		 353 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.56 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.49 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  40.69 
 
 		 369 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  39.55 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.19 
 
 		 426 aa  146  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  37.5 
 
 		 450 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  42.62 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  37.28 
 
 		 338 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  42.08 
 
 		 327 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  37.33 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  42.08 
 
 		 327 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.65 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.6 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  40.11 
 
 		 338 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  38.18 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  44.57 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.97 
 
 		 491 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.72 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  45.4 
 
 		 333 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  37.33 
 
 		 362 aa  144  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  35.9 
 
 		 366 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  37.5 
 
 		 513 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  37.72 
 
 		 366 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  35.84 
 
 		 373 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  35.34 
 
 		 397 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.89 
 
 		 517 aa  143  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  37.69 
 
 		 430 aa  143  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.67 
 
 		 340 aa  143  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  41.58 
 
 		 364 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  41.58 
 
 		 364 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.19 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  39.82 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  36.76 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  35.84 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  36.77 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  36.76 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  36.32 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  38.53 
 
 		 366 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  36.32 
 
 		 372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  37.22 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  36.32 
 
 		 372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  36.32 
 
 		 372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  39.11 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  36.32 
 
 		 372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  36.32 
 
 		 372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  38.07 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  36.64 
 
 		 509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  36.32 
 
 		 372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  43.6 
 
 		 343 aa  141  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.83 
 
 		 680 aa  141  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.73 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  36.02 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  43.43 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  39.23 
 
 		 328 aa  140  6e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  33.8 
 
 		 329 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  33.8 
 
 		 329 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.81 
 
 		 488 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  43.86 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  35.71 
 
 		 454 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>