131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39453 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39453  predicted protein  100 
 
 		 373 aa  758    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0480355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0631  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.95 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.48 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  24.41 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2632  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  26.92 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  24.03 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  24.03 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3859  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.54 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  25.54 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  25.39 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.44 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.64 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0152  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.06 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.693179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  23.64 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  23.64 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.05 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  23.64 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  23.64 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2125  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.4 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.601271  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2367  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.14 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0234131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  23.27 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2802  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.79 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.67 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  24.75 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.83 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1962  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.33 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.07 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  22.57 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.58 
 
 		 322 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0364  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1343  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 335 aa  53.5  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0385  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.693854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25 
 
 		 314 aa  53.1  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.97 
 
 		 324 aa  53.1  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  23.68 
 
 		 311 aa  52.8  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26 
 
 		 322 aa  52.8  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.7 
 
 		 317 aa  52.8  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.74 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  28.11 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  25.4 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  26.11 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4926  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.89 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983704  normal  0.154414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  26.05 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  26.05 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  24.84 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  25.8 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  26.05 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  23.62 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  22.19 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1535  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.97 
 
 		 313 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  25.48 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.92 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  25.95 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4467  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.9 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  25.72 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  25.62 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.33 
 
 		 313 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.02 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  25.72 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  29.79 
 
 		 335 aa  49.7  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.28 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2450  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  25.12 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00033  hypothetical protein  24.06 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00634591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1896  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.13 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00667656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  27.55 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1256  IUNH family nucleoside hydrolase  25.12 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1182  IUNH family nucleoside hydrolase  25.12 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3716  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.17 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  25.4 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  23.7 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696065 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0055  ribonucleoside hydrolase RihC  23.7 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  23.7 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.222927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.12 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2696  hypothetical protein  25.96 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00034  ribonucleoside hydrolase 3  24.06 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00939814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1555  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0742  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.68 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  25.95 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  25.95 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0032  ribonucleoside hydrolase RihC  24.44 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0028  ribonucleoside hydrolase RihC  24.81 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0032  ribonucleoside hydrolase RihC  24.44 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  25 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.44 
 
 		 304 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  27.08 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  25.47 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.08 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2614  hypothetical protein  26.62 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000213544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0034  ribonucleoside hydrolase RihC  24.06 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.58 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1012  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.8 
 
 		 332 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  28.65 
 
 		 350 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  25.08 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0030  ribonucleoside hydrolase RihC  24.34 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719928  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1356  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.19 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  25.48 
 
 		 318 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0804  pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase RihB  23.39 
 
 		 242 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  25 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  25.94 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  25.94 
 
 		 318 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>