More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30672 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30672  ATP-binding transporter  100 
 
 		 828 aa  1696    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104543  normal  0.0203456 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  41.24 
 
 		 782 aa  443  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76772  ATP-binding cassette transporter family member  39.59 
 
 		 575 aa  383  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01820  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.43 
 
 		 725 aa  352  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04730  ATP-binding cassette, sub-family b, member 10, mitochondrial precursor, putative  35.19 
 
 		 725 aa  320  6e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.59161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  38.01 
 
 		 594 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  37.45 
 
 		 581 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  32.83 
 
 		 623 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  34.28 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  34.49 
 
 		 611 aa  298  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  33.28 
 
 		 645 aa  295  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20026  predicted protein  33.33 
 
 		 646 aa  294  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  35.4 
 
 		 606 aa  294  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.95 
 
 		 650 aa  293  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  36.67 
 
 		 598 aa  293  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 598 aa  293  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  32.7 
 
 		 594 aa  292  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  32.43 
 
 		 596 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  33.15 
 
 		 594 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.77 
 
 		 619 aa  287  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.94 
 
 		 616 aa  286  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.09 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35 
 
 		 628 aa  285  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  34.57 
 
 		 614 aa  284  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  35.43 
 
 		 603 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  31.95 
 
 		 601 aa  281  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  31.68 
 
 		 586 aa  280  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.26 
 
 		 601 aa  279  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.89 
 
 		 601 aa  277  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  31.27 
 
 		 600 aa  277  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  33.66 
 
 		 616 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  34.77 
 
 		 597 aa  274  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.83 
 
 		 601 aa  274  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.32 
 
 		 639 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.42 
 
 		 590 aa  272  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.88 
 
 		 616 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.07 
 
 		 586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.54 
 
 		 608 aa  271  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  30.5 
 
 		 586 aa  271  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.11 
 
 		 634 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.62 
 
 		 641 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 586 aa  270  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.69 
 
 		 768 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.99 
 
 		 575 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.02 
 
 		 600 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.99 
 
 		 632 aa  268  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.53 
 
 		 598 aa  267  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.42 
 
 		 597 aa  267  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0888  ABC transporter related  32.89 
 
 		 600 aa  266  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.71 
 
 		 627 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  31.87 
 
 		 619 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0973  ABC transporter related  32.71 
 
 		 600 aa  266  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.53 
 
 		 593 aa  265  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  35.17 
 
 		 784 aa  264  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.08 
 
 		 586 aa  265  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.24 
 
 		 614 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  34.52 
 
 		 597 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  32.9 
 
 		 784 aa  264  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  34.46 
 
 		 726 aa  263  8e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.19 
 
 		 597 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.07 
 
 		 637 aa  263  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.71 
 
 		 589 aa  263  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.23 
 
 		 556 aa  263  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.2 
 
 		 631 aa  261  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  32.52 
 
 		 768 aa  260  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  32.52 
 
 		 814 aa  260  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  31.83 
 
 		 750 aa  259  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  32.02 
 
 		 770 aa  259  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.46 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  32.88 
 
 		 764 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  34.61 
 
 		 578 aa  259  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 		 603 aa  258  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.68 
 
 		 617 aa  258  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.4 
 
 		 600 aa  257  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  31 
 
 		 600 aa  257  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.8 
 
 		 622 aa  257  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.9 
 
 		 600 aa  257  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  33.13 
 
 		 777 aa  256  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  32.66 
 
 		 808 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.12 
 
 		 629 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  34.41 
 
 		 778 aa  255  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.82 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.89 
 
 		 589 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 620 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 773 aa  253  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  31.56 
 
 		 782 aa  253  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.92 
 
 		 606 aa  253  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  29.69 
 
 		 581 aa  252  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  32.48 
 
 		 589 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.44 
 
 		 606 aa  251  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.07 
 
 		 764 aa  251  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.43 
 
 		 617 aa  249  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  29.05 
 
 		 681 aa  249  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  30.15 
 
 		 611 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  33.83 
 
 		 1284 aa  249  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.28 
 
 		 618 aa  249  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  31.9 
 
 		 599 aa  249  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  30.98 
 
 		 782 aa  249  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.48 
 
 		 587 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.83 
 
 		 597 aa  249  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>