More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54477 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02436  ATP citrate lyase, subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10650)  65.67 
 
 
655 aa  843    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54477  atp-citrate synthase  100 
 
 
1082 aa  2237    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00800  conserved hypothetical protein  53.74 
 
 
1149 aa  1191    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1055  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  54.89 
 
 
616 aa  676    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.140026  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0571  ATP-dependent citrate lyase alpha subunit  51.82 
 
 
604 aa  621  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02435  citrate lyase subunit (Eurofung)  45.59 
 
 
485 aa  402  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.031235  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1056  ATP citrate synthase, subunit 1  43.51 
 
 
435 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00742266  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1306  ATP citrate lyase subunit 2  37.29 
 
 
610 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.205597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  37.38 
 
 
610 aa  366  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1231  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  38.61 
 
 
610 aa  366  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1062  citrate lyase, subunit 2  36.79 
 
 
610 aa  357  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0797  citrate lyase, subunit 2  37.73 
 
 
610 aa  356  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1393  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  36.79 
 
 
610 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.025075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  35.89 
 
 
610 aa  349  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0570  ATP-dependent citrate lyase beta subunit  42.25 
 
 
444 aa  342  2.9999999999999998e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1232  ATP-grasp domain protein  34.26 
 
 
398 aa  180  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1392  ATP-grasp domain protein  33.76 
 
 
398 aa  178  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1061  citrate lyase, subunit 1  33.84 
 
 
398 aa  174  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0796  citrate lyase, subunit 1  33.25 
 
 
398 aa  173  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1307  ATP citrate lyase subunit 1  32.58 
 
 
398 aa  172  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.810397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1089  ATP-grasp domain protein  33.33 
 
 
399 aa  171  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.520899  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1350  ATP-grasp domain protein  34.42 
 
 
398 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2334  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit / succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  24.14 
 
 
700 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.530303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1221  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  33.98 
 
 
290 aa  120  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2796  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.82 
 
 
290 aa  117  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.623771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.95 
 
 
290 aa  115  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.82 
 
 
290 aa  115  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.18 
 
 
289 aa  114  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2911  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.92 
 
 
290 aa  114  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1095  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  24.01 
 
 
691 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.82 
 
 
295 aa  114  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1266  CoA-binding domain protein  34.17 
 
 
329 aa  113  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1221  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.02 
 
 
292 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0392735  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3685  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.71 
 
 
295 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43940  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.71 
 
 
295 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.92 
 
 
290 aa  112  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.531627  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0545  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  24.81 
 
 
696 aa  112  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.66 
 
 
290 aa  112  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1387  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.92 
 
 
290 aa  112  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.341558  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2878  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.92 
 
 
290 aa  112  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2965  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.92 
 
 
290 aa  112  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.8 
 
 
289 aa  112  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4185  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.82 
 
 
294 aa  112  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3508  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.82 
 
 
294 aa  112  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214073  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3756  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.82 
 
 
294 aa  112  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29730  Succinyl-CoA ligase, alpha subunit  32.81 
 
 
295 aa  111  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.5 
 
 
290 aa  112  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0517  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  29.41 
 
 
294 aa  112  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1669  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.82 
 
 
294 aa  112  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.212959  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1618  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.33 
 
 
294 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161145  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.42 
 
 
289 aa  111  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.42 
 
 
289 aa  111  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.42 
 
 
289 aa  111  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.42 
 
 
289 aa  111  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.54 
 
 
290 aa  110  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.54 
 
 
290 aa  110  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.66 
 
 
290 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2203  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  32.82 
 
 
293 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2013  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.82 
 
 
293 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143561  normal  0.801568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.8 
 
 
289 aa  109  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.8 
 
 
289 aa  109  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.8 
 
 
289 aa  109  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.8 
 
 
289 aa  109  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.8 
 
 
289 aa  109  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.8 
 
 
289 aa  109  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2102  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  31.66 
 
 
290 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174971  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  31.8 
 
 
289 aa  109  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  30.62 
 
 
290 aa  109  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.8 
 
 
289 aa  109  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1836  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  24.11 
 
 
689 aa  109  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.8 
 
 
289 aa  109  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.8 
 
 
292 aa  108  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.91 
 
 
293 aa  107  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000506874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.27 
 
 
290 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  31.27 
 
 
290 aa  107  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1051  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  32.43 
 
 
290 aa  107  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0859965  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.38 
 
 
291 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.68 
 
 
290 aa  107  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1027  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.57 
 
 
293 aa  106  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0655538  hitchhiker  1.8748700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0192  CoA-binding domain protein  30.38 
 
 
292 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1658  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  32.18 
 
 
293 aa  105  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0963642 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0115  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.15 
 
 
291 aa  105  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0106  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  31.15 
 
 
291 aa  105  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5544  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.48 
 
 
291 aa  105  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1530  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.54 
 
 
293 aa  105  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.250363  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.66 
 
 
290 aa  105  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0774  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.5 
 
 
286 aa  103  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.68 
 
 
290 aa  104  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.5 
 
 
288 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0600  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.89 
 
 
291 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0581  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.89 
 
 
291 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.68 
 
 
290 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  29.96 
 
 
290 aa  103  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.28 
 
 
290 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1373  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.23 
 
 
293 aa  103  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1638  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  29.96 
 
 
290 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0190398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  29.96 
 
 
290 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  29.96 
 
 
290 aa  102  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  30.62 
 
 
290 aa  102  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0605  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.45 
 
 
295 aa  102  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>