42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47198 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47198  predicted protein  100 
 
 		 492 aa  1013    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.459102  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51318  essential for cell growth and replication of M dsRNA virus contains four beta-transducin repeats  22.15 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  28.41 
 
 		 1275 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32777  predicted protein  25.21 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535104  normal  0.359872 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04471  60S ribosome biogenesis protein Mak11, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07570)  26.94 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00650253  normal  0.282575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 914 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.11 
 
 		 608 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 		 1213 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  42.59 
 
 		 1901 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  23.71 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  35.23 
 
 		 816 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  28.26 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.47 
 
 		 1163 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2962  cytochrome c class I  27.78 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1670  WD-40 repeat protein  24.87 
 
 		 520 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.48 
 
 		 1652 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1643  WD-40 repeat protein  24.87 
 
 		 520 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.7 
 
 		 1364 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.3 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.55 
 
 		 1205 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  33.33 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  23.17 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  34.33 
 
 		 742 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1214 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.1 
 
 		 1004 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1477 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  24.76 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 		 682 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 464 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.7 
 
 		 1188 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1807 aa  43.9  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  23.37 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 676 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 		 418 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.53 
 
 		 1247 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  27.81 
 
 		 357 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05200  WD-repeat protein, putative  32.56 
 
 		 988 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48240  Receptor of activated protein kinase C 1B, component of 40S small ribosomal subunit  25.99 
 
 		 321 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19794  Receptor of activated protein kinase C 1A, component of 40S small ribosomal subunit  25.99 
 
 		 321 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  27.81 
 
 		 358 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  23.3 
 
 		 1416 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.32 
 
 		 1831 aa  43.1  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>