47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0293 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  35.29 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  34.44 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  29.84 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  38.28 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  34.11 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  36.24 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  36.24 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  36.81 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  29.63 
 
 		 575 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  34.13 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  28.95 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  27.23 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  27.23 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  32.09 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  30 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  33.33 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  33.33 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  33.33 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  29.32 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  32.64 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  28.8 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  29.89 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  29.35 
 
 		 213 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  29.9 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  34.13 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  30.77 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  29.71 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  29.44 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  31.43 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  29.44 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  30.5 
 
 		 158 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  28.95 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  55.26 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  25.41 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  25.41 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  25.41 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  29.06 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  25.41 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  27.74 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  26.32 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  29.2 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0018  hypothetical protein  27.94 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0542374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3063  protein of unknown function DUF847  32.1 
 
 		 260 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>