53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5445 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 306 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  35.39 
 
 		 392 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  35.39 
 
 		 392 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  34.17 
 
 		 279 aa  139  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  26.88 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.54 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0481  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.3 
 
 		 807 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7019  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.99 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0361  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.75 
 
 		 804 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  32 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  33.99 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3713  relaxase/mobilization nuclease family protein  32.45 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2898  relaxase/mobilization nuclease domain protein  27.01 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000982832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2918  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  26.45 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3018  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.01 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0180  hypothetical protein  30.43 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0133176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.72 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2897  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.1 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0597444  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1709  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.81 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1610  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.18 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  29.1 
 
 		 426 aa  72.4  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2943  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.4 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.71 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4335  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.62 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  21.7 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  33.01 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  23.58 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0321  hypothetical protein  25.58 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.67 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4225  relaxase/mobilization nuclease family protein  38.16 
 
 		 538 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6240  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.65 
 
 		 514 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4196  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.85 
 
 		 423 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.307689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4629  Relaxase/mobilization nuclease family protein  35.53 
 
 		 545 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  28.23 
 
 		 398 aa  53.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3761  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.91 
 
 		 421 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  26.88 
 
 		 650 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3685  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.72 
 
 		 414 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  23.18 
 
 		 746 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  22.45 
 
 		 830 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  30.39 
 
 		 651 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  23.18 
 
 		 746 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4407  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.58 
 
 		 546 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3654  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.22 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  30.39 
 
 		 650 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3563  relaxase/mobilization nuclease family protein  36.23 
 
 		 421 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  30.77 
 
 		 899 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  26.24 
 
 		 752 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4164  relaxase/mobilization nuclease family protein  33 
 
 		 458 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257908  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25 
 
 		 557 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  33.78 
 
 		 805 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  29.67 
 
 		 899 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4380  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.35 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.79 
 
 		 521 aa  42.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>