219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1091 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  100 
 
 
160 aa  328  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  72.96 
 
 
160 aa  249  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  72.96 
 
 
160 aa  249  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  66.25 
 
 
160 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  37.23 
 
 
618 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  35.42 
 
 
101 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  31.76 
 
 
107 aa  62  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.68 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  30.68 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  32.5 
 
 
101 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.25 
 
 
102 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.25 
 
 
127 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  33.73 
 
 
113 aa  57.4  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  37.18 
 
 
137 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  33.7 
 
 
101 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  29.35 
 
 
98 aa  57.4  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  37.74 
 
 
120 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  33.33 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  35 
 
 
118 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  33.7 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  36.11 
 
 
120 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  29.67 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  28.92 
 
 
111 aa  54.3  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  33.33 
 
 
236 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0253  ferredoxin, 2Fe-2S  31.52 
 
 
112 aa  53.9  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  36.14 
 
 
226 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  37.08 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.33 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  35.19 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  40.23 
 
 
578 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  35.62 
 
 
107 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.33 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  38.16 
 
 
226 aa  52.4  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  34.29 
 
 
612 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  33.75 
 
 
112 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  32.89 
 
 
107 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.12 
 
 
112 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1541  ferredoxin, putative  40 
 
 
101 aa  51.6  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1257  ferredoxin  40 
 
 
101 aa  51.6  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  28.26 
 
 
112 aa  51.6  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.67 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.92 
 
 
112 aa  51.6  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  40.98 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2182  ferredoxin, 2Fe-2S type  30.95 
 
 
112 aa  51.2  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  33.66 
 
 
277 aa  51.2  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.68 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  30.69 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  44.07 
 
 
580 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  30.69 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  41.25 
 
 
355 aa  50.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  30.69 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  30.69 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  35.23 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  31.25 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.69 
 
 
111 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  31.25 
 
 
627 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.75 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.75 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  27.5 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  30 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.75 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.5 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  28.75 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  31.71 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  36.96 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.25 
 
 
111 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1439  (2FE-2S) ferredoxin  26.67 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101111  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  31.71 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  27.06 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  32.5 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2285  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.41 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.87 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  29.76 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2183  ferredoxin, 2Fe-2S type  28.41 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  31.68 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.87 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.87 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  27.78 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.87 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.87 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  27.88 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  37.68 
 
 
106 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  31.91 
 
 
222 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  39.08 
 
 
355 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  31.91 
 
 
107 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  29.41 
 
 
644 aa  48.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
561 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  32.93 
 
 
226 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  33.7 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  25.47 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0324676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>