187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0271 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  322  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  53.95 
 
 
224 aa  180  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  56.95 
 
 
219 aa  175  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  51.3 
 
 
211 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  51.3 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  50.68 
 
 
207 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  49.67 
 
 
210 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  51.54 
 
 
206 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  46.21 
 
 
265 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103113 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  39.07 
 
 
161 aa  125  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  39.86 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  33.12 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  36.43 
 
 
236 aa  102  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  35.66 
 
 
219 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  30.87 
 
 
219 aa  97.1  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  34.88 
 
 
220 aa  95.9  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92891  predicted protein  39.23 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.399442  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  28.66 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32792  predicted protein  30.99 
 
 
252 aa  70.5  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  24.62 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  32.37 
 
 
228 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  32.37 
 
 
228 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0306  hypothetical protein  27.43 
 
 
253 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.407855 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
289 aa  54.7  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0727  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.67 
 
 
406 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.560156  normal  0.551186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2293  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
414 aa  54.3  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000690855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0766  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase protein  26.67 
 
 
406 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.159603 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  31.3 
 
 
387 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0740  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.78 
 
 
404 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  31.3 
 
 
387 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  31.3 
 
 
387 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3222  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 
404 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193191  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  35 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32132  predicted protein  25.74 
 
 
328 aa  53.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4836  Methyltransferase type 12  32.89 
 
 
332 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2593  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
406 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.604704  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0513  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.22 
 
 
404 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145575  normal  0.33275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5901  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.97 
 
 
406 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.544208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1958  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
406 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2569  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
406 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  28.41 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33223  predicted protein  35.59 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0013315  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2643  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
413 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2617  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.97 
 
 
406 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  30.53 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2488  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.97 
 
 
406 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697933  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0786  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
406 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0668711  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1123  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.99 
 
 
394 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0181843  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0716  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
406 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.719598  normal  0.139789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  32.88 
 
 
248 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  27.21 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
411 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  25 
 
 
274 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  28.29 
 
 
360 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  29.08 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  30.53 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  35.24 
 
 
202 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.17 
 
 
280 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  28.42 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1307  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.96 
 
 
394 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  27.73 
 
 
248 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0716  cyclopropane fatty acid synthase family protein  27.1 
 
 
406 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000471122  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.09 
 
 
471 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0900  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.1 
 
 
406 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0491432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0358  cyclopropane fatty acid synthase family protein  27.1 
 
 
406 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000119082  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1060  cyclopropane fatty acid synthase family protein  27.1 
 
 
406 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189279  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  30 
 
 
277 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0658  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.1 
 
 
406 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0338601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2493  cyclopropane fatty acid synthase family protein  27.1 
 
 
406 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000280606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0903  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.1 
 
 
406 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00630694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0106  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.1 
 
 
406 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000308019  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  27.05 
 
 
292 aa  47.8  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  26.45 
 
 
877 aa  47.8  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  34.29 
 
 
202 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.68 
 
 
294 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  29 
 
 
419 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
286 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.73 
 
 
398 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6437  predicted protein  30.83 
 
 
297 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3841  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
243 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
266 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
328 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.43 
 
 
419 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.52 
 
 
306 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.52 
 
 
293 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1292  hypothetical protein  34.12 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.263548  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  23.39 
 
 
282 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.06 
 
 
312 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.52 
 
 
293 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  31.51 
 
 
248 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  28.57 
 
 
387 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3025  hypothetical protein  24.75 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.46 
 
 
415 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
295 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
293 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
295 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43583  predicted protein  34.62 
 
 
224 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.68 
 
 
304 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>