228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2658 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 348 aa  695    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  30.48 
 
 		 358 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  27.13 
 
 		 375 aa  95.9  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  30.33 
 
 		 430 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  30.16 
 
 		 363 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  29.32 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  30.2 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  26.38 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  26.38 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  27.01 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  29.47 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  28.21 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  27.27 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  27.35 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  26.67 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  25.68 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  26.77 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  27.95 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  26.69 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  31.13 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  26.12 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.85 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  30.52 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  30.52 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6989  acyltransferase-like protein  27.94 
 
 		 395 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  26.25 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  31.17 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  30.84 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5253  hypothetical protein  30.15 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  26.15 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  32.29 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  26.63 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  25.93 
 
 		 673 aa  63.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.93 
 
 		 660 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  26.34 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  28.62 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  26.4 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  29.81 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  25 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  25.86 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  26.06 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  22.86 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  25.89 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  23.9 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  24.27 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  26.59 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  22.61 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2263  acyltransferase 3  25.52 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  26.42 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  24.61 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  26.82 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1765  acyltransferase 3  24.32 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  28 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  25.95 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  25.95 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  26.64 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  23.01 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  24.54 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  32.67 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  25.71 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  22.55 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  22.55 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  28.1 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  22.55 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  25.32 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2569  acyltransferase 3  25 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1288  acyltransferase 3  27.13 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.463574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  26.95 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  22.72 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3191  acyltransferase 3  27.86 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  27.15 
 
 		 690 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  25.14 
 
 		 716 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  25.11 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  24.79 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  27.36 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  28.03 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  27.65 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  25.15 
 
 		 642 aa  55.8  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  26.03 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  23.25 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.32 
 
 		 639 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56390  hypothetical protein  26.94 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  26.82 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  25.16 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  25.48 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  21.41 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  28.9 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  22.19 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  22.19 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  25.57 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  26.91 
 
 		 665 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  26.53 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  26.73 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  23.82 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  26.18 
 
 		 660 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2610  acyltransferase 3  25.58 
 
 		 555 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  30.92 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  23.74 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  23.76 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0052  hypothetical protein  25.22 
 
 		 592 aa  53.1  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000983267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>