88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4908  hypothetical protein  96.95 
 
 		 426 aa  751    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56390  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  844    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2263  acyltransferase 3  56.74 
 
 		 425 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2569  acyltransferase 3  56.9 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1765  acyltransferase 3  57.87 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1847  acyltransferase 3  56.45 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1288  acyltransferase 3  53.03 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.463574  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4602  acyltransferase 3  37.92 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  30.45 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  29.87 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  28.98 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  26.13 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  26.79 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  31.03 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  28.3 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  28.65 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  26.84 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  24.71 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  29.08 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  24.41 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  29.83 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  26.18 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  29.01 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  26.94 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  28.35 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  28.71 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  26.65 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  31.89 
 
 		 367 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  28.01 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  25.88 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  27.56 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  31.08 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  25.86 
 
 		 362 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  26.72 
 
 		 360 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  26.98 
 
 		 365 aa  51.2  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  28.65 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  29.38 
 
 		 361 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  35.63 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  26.09 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  30.46 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  27.65 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  30.1 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  32.26 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  26.74 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  29.22 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  32.32 
 
 		 356 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  27.87 
 
 		 584 aa  47.8  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0023  hypothetical protein  28.27 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0020  hypothetical protein  28.27 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  27.21 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2651  acyltransferase 3  27.03 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  24.05 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.61 
 
 		 638 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  28.15 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  30.43 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5253  hypothetical protein  34.31 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  26.19 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0034  acyltransferase 3  26.06 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  23.36 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  29.11 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  26.17 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2879  hypothetical protein  33.02 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  27.35 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  30.06 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  26.85 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  27.35 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  32.18 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  25.3 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  27.35 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  23.91 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  25.54 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44980  predicted protein  25.22 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0593  acyltransferase 3  31.45 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  25.74 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  31.25 
 
 		 243 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  31.46 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  28.92 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  35.71 
 
 		 342 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  26.57 
 
 		 354 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  26.82 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  25.13 
 
 		 312 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  29.68 
 
 		 362 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  23.56 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  28.3 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  29.53 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  24.87 
 
 		 383 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  28.75 
 
 		 598 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>