More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2470 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  532  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  97.24 
 
 		 254 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  53.6 
 
 		 253 aa  292  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  53.6 
 
 		 253 aa  292  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  49.2 
 
 		 248 aa  258  8e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  33.73 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2049  methyltransferase type 11  38.93 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0755  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12641  methyltransferase  37.25 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4407  methyltransferase type 11  37.15 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1187  methyltransferase type 11  33.99 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1727  Methyltransferase type 11  33.46 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.312488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0817  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4465  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375613  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.8 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  29.91 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  29.8 
 
 		 239 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  29.44 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2036  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  27.57 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  28.72 
 
 		 239 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  27.1 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  27.13 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  27.13 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  28.7 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  37.98 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.43 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.85 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.11 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.8 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  39.29 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.45 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.45 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.95 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.88 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.88 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.88 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  23.4 
 
 		 559 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  30.46 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.22 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  33.64 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.05 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  35 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.39 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.13 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.51 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.51 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  32.39 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.57 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.46 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.59 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  29.61 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.34 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  27.92 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  25.94 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.45 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.82 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.46 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.46 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.04 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.53 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.48 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.39 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.06 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.21 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>