More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14901 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14901  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
412 aa  827    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15151  tyrosyl-tRNA synthetase  82.52 
 
 
412 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1427  tyrosyl-tRNA synthetase  82.77 
 
 
412 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15291  tyrosyl-tRNA synthetase  82.04 
 
 
412 aa  696    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13831  tyrosyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
415 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17561  tyrosyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 
415 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05611  tyrosyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 
408 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0900  tyrosyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2102  tyrosyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
415 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0567  tyrosyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 
415 aa  481  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0445  tyrosyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3195  tyrosyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
407 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2901  tyrosyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
407 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2570  tyrosyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
402 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56306  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1292  tyrosyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
406 aa  434  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0857  tyrosyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 
403 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.16761  hitchhiker  0.00258196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0925  tyrosyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
398 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2067  tyrosyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
413 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
406 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
407 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
413 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
413 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
413 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
413 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
413 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
413 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
407 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
401 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  41.61 
 
 
438 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
413 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
410 aa  302  8.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
432 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
413 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
432 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
410 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
392 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
421 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
410 aa  300  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
401 aa  300  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
413 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
421 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
399 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
405 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
406 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
413 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
412 aa  296  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
401 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
400 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
400 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
413 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
410 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0058  tyrosyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
397 aa  292  7e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000304834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
405 aa  292  8e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
407 aa  292  8e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3150  tyrosyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
424 aa  292  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0347035  hitchhiker  0.00193972 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
392 aa  290  3e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
404 aa  290  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02940  tyrosyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
403 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131327  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4045  tyrosyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
410 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
399 aa  289  7e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
403 aa  289  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
395 aa  288  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
399 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
410 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
388 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
400 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 
400 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0506  tyrosyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
403 aa  286  4e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
398 aa  285  7e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0632  tyrosyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1714  tyrosyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
405 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0611  tyrosyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
396 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
395 aa  282  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0728  tyrosyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
414 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>