More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17551 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  65.67 
 
 
200 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  62.44 
 
 
202 aa  274  5e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  57.95 
 
 
200 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  57.95 
 
 
200 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  52.74 
 
 
202 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  47.29 
 
 
203 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  47.92 
 
 
203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  47.4 
 
 
203 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  43.35 
 
 
203 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  42.59 
 
 
135 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  39.83 
 
 
137 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  38.66 
 
 
134 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  38.66 
 
 
133 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  38.66 
 
 
133 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  38.66 
 
 
133 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  38.89 
 
 
147 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  37.82 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  37.82 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  37.29 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  36.7 
 
 
143 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  36.7 
 
 
143 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  35.78 
 
 
143 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  35.78 
 
 
143 aa  73.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  39.62 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  35.85 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  35.51 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  35.51 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  35.51 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  35.51 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  35.51 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  37.1 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  34.86 
 
 
130 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.37 
 
 
134 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  30.39 
 
 
134 aa  62  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  38.27 
 
 
86 aa  58.2  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  37.04 
 
 
85 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  34.21 
 
 
103 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.15 
 
 
459 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  32.89 
 
 
103 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  29.41 
 
 
130 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  35.62 
 
 
110 aa  54.7  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 
103 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  31.71 
 
 
442 aa  54.7  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  34.25 
 
 
308 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  34.25 
 
 
308 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  31.58 
 
 
103 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 
115 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 
103 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  35.44 
 
 
85 aa  52.8  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0187  glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 
111 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381703  normal  0.468757 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  29.81 
 
 
238 aa  52  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  33.33 
 
 
223 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  28.38 
 
 
107 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  35 
 
 
84 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 
103 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 
117 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  31.76 
 
 
101 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1610  glutaredoxin-like protein  37.68 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 
103 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 
103 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 
103 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  29.81 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 
107 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 
107 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  26.98 
 
 
143 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2784  glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 
107 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 
103 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  35.87 
 
 
96 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  36.71 
 
 
82 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  28.95 
 
 
110 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  30.23 
 
 
87 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  35.87 
 
 
96 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  29.27 
 
 
90 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  36.25 
 
 
84 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  36.71 
 
 
82 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  31.25 
 
 
87 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  30.23 
 
 
87 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  36.71 
 
 
82 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 
103 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 
103 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 
103 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  28.21 
 
 
110 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 
102 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 
103 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  27.63 
 
 
109 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 
102 aa  48.5  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  28.38 
 
 
107 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  28.57 
 
 
249 aa  48.5  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27972  predicted protein  31.94 
 
 
338 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  33.75 
 
 
84 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  28.95 
 
 
102 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  33.33 
 
 
84 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  30.59 
 
 
101 aa  48.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  28.95 
 
 
102 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
81 aa  48.1  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  37.18 
 
 
83 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  37.18 
 
 
83 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  28.95 
 
 
102 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  37.18 
 
 
83 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>