More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02251 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  50.89 
 
 
857 aa  704    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  50.89 
 
 
857 aa  704    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  48.12 
 
 
865 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0625  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  51.06 
 
 
854 aa  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0977659  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  42.42 
 
 
863 aa  681    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  52.52 
 
 
859 aa  692    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48.92 
 
 
859 aa  687    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1335  ATP-dependent protease  44.57 
 
 
862 aa  696    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255547  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  49.52 
 
 
861 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.08 
 
 
874 aa  702    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  50.42 
 
 
857 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  52.43 
 
 
854 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.02 
 
 
865 aa  694    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  49.67 
 
 
858 aa  711    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  49.67 
 
 
858 aa  711    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  52.16 
 
 
854 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  50.97 
 
 
865 aa  707    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  43.67 
 
 
863 aa  693    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0200  ATPase  44.43 
 
 
867 aa  683    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371355  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0016  ATPase  44.44 
 
 
863 aa  731    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1574  ATPase  61.36 
 
 
931 aa  1090    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.513125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.82 
 
 
862 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0645  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  46.37 
 
 
857 aa  679    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  42.72 
 
 
891 aa  705    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  46.33 
 
 
873 aa  802    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  47.96 
 
 
876 aa  820    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  44.94 
 
 
872 aa  789    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  43.72 
 
 
865 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  48.38 
 
 
865 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4834  chaperone clpB  44.5 
 
 
854 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0201945  normal  0.188995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  42.17 
 
 
870 aa  690    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  42.65 
 
 
865 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  44.13 
 
 
862 aa  756    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2159  ATPase  57.79 
 
 
941 aa  1040    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.513244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  44.59 
 
 
862 aa  738    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2474  ATPase  57.88 
 
 
924 aa  1033    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.786045  normal  0.0534702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  47.49 
 
 
864 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0414  AAA ATPase  49.53 
 
 
854 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.817995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0209  ATPase  50.22 
 
 
918 aa  905    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0580  ATPase  41.25 
 
 
860 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.791639  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0637  ATPase  48.26 
 
 
895 aa  801    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0120026  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  46.2 
 
 
883 aa  804    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  48.42 
 
 
869 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  41.81 
 
 
870 aa  691    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.8 
 
 
865 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  43.66 
 
 
870 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4356  ATPase AAA-2  49.86 
 
 
869 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  42.43 
 
 
879 aa  714    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  40.55 
 
 
859 aa  684    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  49.43 
 
 
865 aa  689    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0119  ClpB protein  41.55 
 
 
854 aa  676    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0367  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.72 
 
 
857 aa  679    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  41.25 
 
 
871 aa  688    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  45.56 
 
 
870 aa  701    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2548  ClpB protein  47.97 
 
 
876 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  43.72 
 
 
879 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  49.52 
 
 
861 aa  687    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  51.25 
 
 
866 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  42.76 
 
 
865 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2861  ATPase AAA-2  50.84 
 
 
862 aa  688    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2199  ATPase AAA-2  43.32 
 
 
869 aa  694    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0278692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  43.41 
 
 
879 aa  707    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  49.12 
 
 
860 aa  684    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  42.92 
 
 
878 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  50.97 
 
 
865 aa  704    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  48.4 
 
 
862 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0194  ATP-dependent chaperone protein ClpB  42.35 
 
 
862 aa  684    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.68228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  48.31 
 
 
878 aa  685    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  50.7 
 
 
861 aa  691    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  42.73 
 
 
862 aa  709    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  41.87 
 
 
859 aa  701    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  48.8 
 
 
865 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  43.74 
 
 
848 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  49.93 
 
 
858 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  43.66 
 
 
891 aa  716    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3123  heat shock protein  42.54 
 
 
871 aa  681    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  50 
 
 
856 aa  676    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  44.57 
 
 
870 aa  775    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3490  ATPase AAA-2  48.53 
 
 
905 aa  803    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  49.04 
 
 
857 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  49.04 
 
 
857 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  50.7 
 
 
864 aa  701    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  50.14 
 
 
865 aa  685    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  43.59 
 
 
868 aa  709    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  49 
 
 
865 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  44.72 
 
 
854 aa  715    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1612  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  51.39 
 
 
867 aa  687    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.176482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  49.3 
 
 
889 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  48.8 
 
 
865 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0263  ATPase  48.06 
 
 
873 aa  674    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.602009  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0147  ATPase  49.93 
 
 
861 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.919618  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  49.04 
 
 
857 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  43.41 
 
 
864 aa  683    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  41.9 
 
 
873 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  48.3 
 
 
875 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  50.56 
 
 
857 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  43.74 
 
 
848 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  49.65 
 
 
848 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  44.79 
 
 
859 aa  715    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  43.26 
 
 
865 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>