More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3918 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 495 aa  985    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  43.94 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.94 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  43.94 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  43.94 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  43.94 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  43.94 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  43.47 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  43.68 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  43.68 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  43.68 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  43.72 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.72 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  43.72 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  43.68 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.6 
 
 		 475 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.77 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  42.55 
 
 		 474 aa  364  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0009  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000216435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4207  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0009  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000535821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1410  hypothetical protein  44.84 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05990  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.84 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.05141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.86 
 
 		 475 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237506  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0562  MFS family transporter  43.63 
 
 		 477 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.17 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4805  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 468 aa  352  8e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675346  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  38.41 
 
 		 484 aa  352  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.26 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1590  hypothetical protein  44.18 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  39.92 
 
 		 491 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4675  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 471 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.09 
 
 		 490 aa  346  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4951  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.51 
 
 		 475 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4824  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.51 
 
 		 475 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0486949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 490 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 495 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0779  major facilitator superfamily drug efflux pump  39.74 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0480  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 488 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2259  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.06 
 
 		 479 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.41183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0945  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  41.06 
 
 		 479 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0941  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  41.06 
 
 		 479 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13812  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2136  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  41.06 
 
 		 479 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0556  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  41.06 
 
 		 479 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3187  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.62 
 
 		 485 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  42.55 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1095  MFS transporter  41.06 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  40.57 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.17 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.29 
 
 		 478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2454  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.83 
 
 		 478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000627963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.69 
 
 		 490 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.79 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0514  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.54 
 
 		 475 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.09 
 
 		 489 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0492879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.79 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0730599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 		 494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5000  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.31 
 
 		 475 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1665  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.43 
 
 		 478 aa  336  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 		 478 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.45 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.61 
 
 		 483 aa  334  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2090  major facilitator superfamily transporter  41.43 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126245  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 499 aa  332  9e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 498 aa  329  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0407  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  41.94 
 
 		 462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  38.36 
 
 		 477 aa  327  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4048  major facilitator superfamily transporter  41.49 
 
 		 482 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.34 
 
 		 469 aa  324  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.18 
 
 		 474 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.7 
 
 		 465 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.61 
 
 		 467 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.61 
 
 		 470 aa  322  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4769  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 470 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 471 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  40.13 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 479 aa  319  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 465 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3040  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.14 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.071182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.43 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 471 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.43 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 471 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 462 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 472 aa  317  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>