197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1990 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1990  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 341 aa  685    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4277  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4284  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4311  LacI family transcription regulator  29.68 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3108  transcriptional regulators-like protein  33.64 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1018  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4267  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3203  LacI family transcription regulator  29.83 
 
 		 375 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0127391  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3374  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1357  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4310  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4343  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.905515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0521  LacI family transcription regulator  30.43 
 
 		 364 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0520  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4286  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  27.05 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  23 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1273  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690479  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  25.78 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3954  LacI family transcription regulator  21.97 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.647552  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3460  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.78 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4113  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  21.47 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3965  LacI family transcription regulator  21.17 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4433  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  21.47 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4230  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  21.47 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0911  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  20.7 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.73 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  24.85 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4286  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  20.36 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4341  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  20.67 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4066  LacI family transcription regulator  22.16 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4322  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  22.16 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  23.78 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.2 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01255  putative LacI-family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.87 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  24.39 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  26 
 
 		 327 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1990  alanine racemase  27.82 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  21.82 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  23.91 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  26.32 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1245  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  19.76 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  19.76 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1423  transcriptional regulator, LacI family  22.62 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.189138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  28.51 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  24.32 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  19.76 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  42.59 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.52 
 
 		 341 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  26.39 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1526  transcriptional regulator, LacI family  47.06 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.291045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1186  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  19.76 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0999  LacI family transcription regulator  19.76 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  19.76 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5093  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  20.23 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1164  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  19.76 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6824  transcriptional regulator, LacI family  43.14 
 
 		 355 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  21.93 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4188  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  19.76 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  23.32 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0234  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  19.2 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.762891  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  48.89 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0194  LacI family transcription regulator  20.41 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.18 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  39.66 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  23.74 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  46.94 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  26.67 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1118  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  19.46 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  48.08 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  27.09 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1553  transcriptional regulator, LacI family  24.87 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  26.9 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0837  alanine racemase  19.76 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  40 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0232  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  19.64 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2945  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.4 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.884709 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0302  sugar-binding protein, putative  44.44 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2844  transcriptional regulator, LacI family  27.24 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0556143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  22.16 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0278  putative sugar-binding protein  44.44 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  22.11 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5195  LacI family transcription regulator  19.23 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  24.4 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  26.29 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  31.47 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5083  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  19.81 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000690772  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2386  LacI family transcription regulator  27.18 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737452  normal  0.472555 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0252  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  19.48 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1177  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.08 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  24.75 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1965  transcriptional regulator, LacI family  24.37 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36400  transcriptional regulator  52 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>