More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_49676 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  100 
 
 		 499 aa  1043    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  55.23 
 
 		 495 aa  548  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07028  hypothetical protein similar to thymidylate synthase (Broad)  57.19 
 
 		 674 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37780  Thymidylate synthase  57.14 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0107754 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01230  thymidylate synthase  59.87 
 
 		 317 aa  360  3e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0538613  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_2087  predicted protein  75.81 
 
 		 217 aa  335  9e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  52.84 
 
 		 264 aa  319  9e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 264 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  53.38 
 
 		 264 aa  315  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  53.19 
 
 		 264 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  52.84 
 
 		 264 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  53.55 
 
 		 264 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  53.55 
 
 		 264 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 264 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  52.65 
 
 		 264 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  53.19 
 
 		 264 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 264 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  53.19 
 
 		 264 aa  312  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 264 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  50 
 
 		 285 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 264 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  51.96 
 
 		 264 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  51.96 
 
 		 264 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  52.67 
 
 		 264 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  51.6 
 
 		 264 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  53.02 
 
 		 264 aa  307  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  52.48 
 
 		 264 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  51.59 
 
 		 264 aa  306  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  51.25 
 
 		 264 aa  306  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  51.25 
 
 		 264 aa  306  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 264 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 264 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 286 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  49.01 
 
 		 283 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  47.24 
 
 		 318 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  50.35 
 
 		 264 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 264 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  47.24 
 
 		 318 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  52.31 
 
 		 264 aa  302  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  50.71 
 
 		 264 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  46.94 
 
 		 290 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 267 aa  301  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  48.26 
 
 		 300 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  50.17 
 
 		 277 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  50.18 
 
 		 264 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  49.83 
 
 		 290 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  46.93 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  46.93 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  46.93 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  46.93 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  46.93 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  46.93 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  52.31 
 
 		 264 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  46.93 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  46.93 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  50.35 
 
 		 264 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  300  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  51.42 
 
 		 264 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  51.6 
 
 		 290 aa  300  4e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  300  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  49.83 
 
 		 277 aa  300  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 264 aa  300  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  51.77 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  51.77 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  51.77 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  51.77 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  51.77 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  299  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  50.35 
 
 		 283 aa  299  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  299  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  51.96 
 
 		 264 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  299  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  51.96 
 
 		 264 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  50.53 
 
 		 264 aa  298  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  49.11 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  50.71 
 
 		 264 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  51.25 
 
 		 267 aa  298  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  48.47 
 
 		 274 aa  298  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  50.71 
 
 		 264 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  50.71 
 
 		 264 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  50.71 
 
 		 264 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  51.96 
 
 		 264 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  51.2 
 
 		 273 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>