More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42872 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_42872  predicted protein  100 
 
 
503 aa  1025    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.701812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.01 
 
 
486 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.81 
 
 
484 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.92 
 
 
509 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.1 
 
 
486 aa  522  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.62 
 
 
493 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.18 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.97 
 
 
489 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.98 
 
 
503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.18 
 
 
503 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.77 
 
 
489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.18 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.56 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.18 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
485 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  55.51 
 
 
480 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.27 
 
 
485 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.3 
 
 
489 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.63 
 
 
496 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.16 
 
 
493 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.24 
 
 
483 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.77 
 
 
489 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.66 
 
 
482 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.07 
 
 
493 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
486 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.87 
 
 
482 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.18 
 
 
492 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
482 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  54 
 
 
482 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.69 
 
 
489 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.59 
 
 
482 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.48 
 
 
489 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.69 
 
 
489 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.23 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.33 
 
 
483 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
479 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.46 
 
 
482 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.33 
 
 
490 aa  505  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.69 
 
 
489 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  53.69 
 
 
489 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.46 
 
 
482 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.69 
 
 
489 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.15 
 
 
479 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0428  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.36 
 
 
486 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.84 
 
 
480 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.25 
 
 
482 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.84 
 
 
480 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.53 
 
 
483 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.16 
 
 
484 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.59 
 
 
482 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.12 
 
 
483 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.32 
 
 
483 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.32 
 
 
499 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.32 
 
 
499 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.9 
 
 
486 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.88 
 
 
502 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.41 
 
 
485 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.93 
 
 
479 aa  498  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.55 
 
 
483 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.45 
 
 
482 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
486 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.19 
 
 
488 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.69 
 
 
482 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.21 
 
 
482 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.02 
 
 
480 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
500 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.93 
 
 
484 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.21 
 
 
482 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.08 
 
 
489 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.21 
 
 
482 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.53 
 
 
490 aa  495  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.55 
 
 
485 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2373  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
486 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.82 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.08 
 
 
479 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.02 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50 
 
 
482 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.82 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.82 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  51.45 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.23 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
490 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.66 
 
 
492 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.92 
 
 
490 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.95 
 
 
492 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.67 
 
 
492 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.12 
 
 
482 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
483 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.91 
 
 
482 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.12 
 
 
482 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.07 
 
 
484 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.1 
 
 
483 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.36 
 
 
483 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.1 
 
 
486 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.16 
 
 
484 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.12 
 
 
482 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0917  succinate-semialdehyde dehydrogenase(NADP+)  51.53 
 
 
476 aa  490  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0952365  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.31 
 
 
486 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
492 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>