84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0951 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0951  glutamine synthetase repressor  100 
 
 		 110 aa  222  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394766  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0716  glutamine synthetase repressor  50.89 
 
 		 112 aa  117  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  40.37 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  37.84 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  36.79 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  41.33 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  40.26 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  35.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  35.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  35.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  35.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  35.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  35.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  35.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  32.29 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  41.27 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  34.85 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  37.14 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 304 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  29.76 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 133 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  37.18 
 
 		 195 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 251 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 156 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 133 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 128 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 253 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 253 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 253 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 253 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  36 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  35.62 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  29.55 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  37.04 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0323  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0420386  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 128 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 171 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2312  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 198 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>