More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3049 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
260 aa  508  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  81.08 
 
 
260 aa  418  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  71.21 
 
 
260 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  68.48 
 
 
260 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  68.11 
 
 
259 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  67.83 
 
 
260 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  63.18 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  56.2 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  48.58 
 
 
266 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  51.16 
 
 
271 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  49.8 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  46.64 
 
 
259 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  47.83 
 
 
271 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  50.43 
 
 
260 aa  189  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  45.85 
 
 
270 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  41.73 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.68 
 
 
255 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  41.2 
 
 
258 aa  181  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  47.06 
 
 
267 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
250 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  42.86 
 
 
250 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  48.44 
 
 
271 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  37.13 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  39.29 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.56 
 
 
405 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  47.84 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  39.24 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  48.05 
 
 
271 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  43.5 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
536 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.87 
 
 
266 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.56 
 
 
266 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.08 
 
 
263 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.84 
 
 
424 aa  168  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  41.6 
 
 
414 aa  168  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  39.08 
 
 
263 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  41.88 
 
 
271 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.34 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  43.51 
 
 
260 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.5 
 
 
490 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  43.1 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  39.17 
 
 
424 aa  165  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  42.62 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1432  ABC transporter related  34.68 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  38.24 
 
 
254 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.62 
 
 
255 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
258 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  32.54 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3088  ABC transporter related  49.78 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.62 
 
 
255 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  43.53 
 
 
264 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
263 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  34.68 
 
 
253 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
266 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.49 
 
 
270 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 
258 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 
266 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  40.73 
 
 
272 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.15 
 
 
255 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  40.83 
 
 
254 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.18 
 
 
274 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  37.71 
 
 
255 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  37.71 
 
 
255 aa  158  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  37.71 
 
 
255 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 
265 aa  158  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.71 
 
 
255 aa  158  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
272 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.82 
 
 
267 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  41.95 
 
 
255 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
262 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  37.92 
 
 
254 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.24 
 
 
268 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  35.56 
 
 
269 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  35.56 
 
 
269 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  39.51 
 
 
255 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.29 
 
 
255 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  35.78 
 
 
252 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  36.12 
 
 
255 aa  155  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  33.97 
 
 
264 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  41.67 
 
 
255 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.62 
 
 
625 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
273 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
273 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.05 
 
 
273 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  39.5 
 
 
269 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 
259 aa  155  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  39.15 
 
 
293 aa  155  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.92 
 
 
255 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  42.74 
 
 
273 aa  155  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  43.36 
 
 
274 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  39.17 
 
 
282 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  43.84 
 
 
243 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  36.91 
 
 
253 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.02 
 
 
274 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
273 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
257 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 
273 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>