More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2148 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2148  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
508 aa  1028    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1248  hypothetical protein  42.55 
 
 
502 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1984  hypothetical protein  41.04 
 
 
505 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156638  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0853  hypothetical protein  41.26 
 
 
550 aa  356  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0654  6-hydroxynicotinate reductase  42.58 
 
 
543 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4323  hypothetical protein  41.92 
 
 
542 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1667  hypothetical protein  41.7 
 
 
498 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0364929  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4068  6-hydroxynicotinate reductase  41.51 
 
 
526 aa  351  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353836  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4211  hypothetical protein  40.71 
 
 
501 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.337138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2425  6-hydroxynicotinate reductase  40.89 
 
 
482 aa  345  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842752  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0178  6-hydroxynicotinate reductase  42.42 
 
 
538 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  47.37 
 
 
448 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  40.32 
 
 
443 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  42.11 
 
 
435 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.15 
 
 
267 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48 
 
 
370 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.11 
 
 
443 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3798  Fe-S cluster domain-containing protein  41.94 
 
 
427 aa  57.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.818918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.68 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.3 
 
 
1016 aa  55.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.33 
 
 
425 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  40.35 
 
 
598 aa  54.7  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  50 
 
 
633 aa  54.3  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.1 
 
 
238 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1327  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.15 
 
 
615 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.344045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1774  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 
205 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.23 
 
 
221 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2487  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.23 
 
 
243 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1546  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.59 
 
 
377 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.92 
 
 
268 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  41.82 
 
 
597 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0635  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  42.86 
 
 
612 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  40 
 
 
371 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1494  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50.98 
 
 
57 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1133  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  41.82 
 
 
601 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.028644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  39.66 
 
 
791 aa  51.6  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  47.27 
 
 
273 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.1 
 
 
392 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000930886  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  40.68 
 
 
612 aa  50.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0890534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0593  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.31 
 
 
445 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.12 
 
 
373 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.62 
 
 
762 aa  50.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2376  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.23 
 
 
231 aa  50.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.532877  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
105 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  41.51 
 
 
612 aa  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  31.87 
 
 
574 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.59 
 
 
367 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  37.74 
 
 
595 aa  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1318  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.18 
 
 
612 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  33.85 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  40.82 
 
 
596 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0058  indolepyruvate oxidoreductase, subunit  45.28 
 
 
600 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602223  normal  0.513175 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.33 
 
 
674 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  39.62 
 
 
597 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.15 
 
 
658 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.38 
 
 
176 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2420  ferredoxin family protein  36.84 
 
 
83 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.498162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  42.22 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  46.34 
 
 
634 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
153 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  39.62 
 
 
623 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
365 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  44 
 
 
610 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.15 
 
 
658 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.09 
 
 
113 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2341  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.1 
 
 
232 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0747882  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.62 
 
 
642 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  40 
 
 
594 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  33.85 
 
 
410 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1322  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.33 
 
 
267 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  33.85 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0974  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.15 
 
 
658 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.540369  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1597  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.08 
 
 
607 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2137  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.82 
 
 
214 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  37.04 
 
 
144 aa  49.3  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2242  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.51 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193529  normal  0.0185551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0591  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463263  normal  0.063336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.1 
 
 
368 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.33 
 
 
361 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0946  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.82 
 
 
577 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.31 
 
 
288 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  34 
 
 
248 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1212  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 
655 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 
577 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.94 
 
 
674 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1358  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.07 
 
 
612 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0762  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  43.14 
 
 
628 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1113  NIL domain protein  36.67 
 
 
147 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.646686  normal  0.0231239 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1082  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.71 
 
 
606 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0168  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.33 
 
 
141 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  35.71 
 
 
278 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  36.36 
 
 
500 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  43.14 
 
 
188 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0473015  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.53 
 
 
755 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.1 
 
 
286 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  42.59 
 
 
604 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.33 
 
 
491 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114933 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.02 
 
 
617 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.62 
 
 
377 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>