More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1951 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  100 
 
 
246 aa  504  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  62.03 
 
 
245 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  61.6 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  61.6 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  61.6 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  61.6 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  61.6 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  61.6 
 
 
245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  61.6 
 
 
245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  61.6 
 
 
245 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  61.6 
 
 
245 aa  310  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  62.61 
 
 
255 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  63.14 
 
 
256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  62.29 
 
 
245 aa  299  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  62.34 
 
 
245 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  60.09 
 
 
238 aa  298  6e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  59.23 
 
 
246 aa  298  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  60.17 
 
 
261 aa  298  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  61.44 
 
 
263 aa  296  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  58.16 
 
 
250 aa  295  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  59.74 
 
 
248 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  60.35 
 
 
231 aa  288  6e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  61.64 
 
 
247 aa  288  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  55.79 
 
 
238 aa  286  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  61.9 
 
 
239 aa  285  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  58.01 
 
 
248 aa  284  8e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  56.65 
 
 
238 aa  284  9e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  58.97 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  55.51 
 
 
238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  58.97 
 
 
239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  56.22 
 
 
238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  56.9 
 
 
241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  58.8 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  57.51 
 
 
242 aa  281  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  56.71 
 
 
243 aa  280  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  57.51 
 
 
242 aa  280  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  57.51 
 
 
242 aa  280  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  56.03 
 
 
241 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  58.82 
 
 
238 aa  279  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  54.11 
 
 
255 aa  278  5e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  58.55 
 
 
243 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  55.36 
 
 
240 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  58.62 
 
 
238 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  61.23 
 
 
232 aa  277  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  55.79 
 
 
239 aa  276  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  58.37 
 
 
258 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  56.65 
 
 
245 aa  275  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  57.08 
 
 
238 aa  274  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  55.74 
 
 
238 aa  274  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  55.46 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  56.22 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  57.58 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  57.08 
 
 
246 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  56.9 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  55.41 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  56.28 
 
 
239 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  55.41 
 
 
244 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  58.44 
 
 
238 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  55.93 
 
 
257 aa  271  6e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  58.44 
 
 
238 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  58.44 
 
 
238 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  58.44 
 
 
238 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  58.44 
 
 
238 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  56.65 
 
 
239 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  56.65 
 
 
239 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  56.65 
 
 
238 aa  271  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  55.17 
 
 
238 aa  271  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  57.14 
 
 
243 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  58.01 
 
 
238 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  57.2 
 
 
244 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  55.13 
 
 
238 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  55.27 
 
 
238 aa  270  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  57.51 
 
 
238 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  57.58 
 
 
238 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  54.47 
 
 
238 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  55.84 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  55.84 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  55.84 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  55.84 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  55.84 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  55.84 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  56.65 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  55.17 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  55.36 
 
 
238 aa  268  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  54.85 
 
 
240 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  57.33 
 
 
238 aa  268  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  55.84 
 
 
235 aa  268  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  55.84 
 
 
235 aa  268  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  55.84 
 
 
243 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  54.98 
 
 
238 aa  268  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  53.65 
 
 
244 aa  268  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  56.65 
 
 
238 aa  268  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  54.74 
 
 
238 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  58.19 
 
 
237 aa  267  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  56.9 
 
 
238 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  56.9 
 
 
238 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  56.9 
 
 
238 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  55.17 
 
 
241 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  56.9 
 
 
238 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  56.9 
 
 
238 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>