80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4376 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  100 
 
 		 250 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  66.53 
 
 		 250 aa  308  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  64.8 
 
 		 251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  63.2 
 
 		 251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  60.16 
 
 		 252 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  65.2 
 
 		 250 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  61.69 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  52.4 
 
 		 249 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  58.3 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  52.87 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  46.6 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  45.08 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  42.06 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  38.96 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  35.14 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  34.33 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  34.33 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  34.33 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  38.71 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  38.71 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  38.71 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  40.71 
 
 		 425 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.71 
 
 		 425 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  30.77 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  60.56 
 
 		 96 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  28.06 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  27.91 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  28.38 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25.24 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  26.97 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  26.98 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  29.86 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.58 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  30 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  27.85 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.58 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  25.82 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  27.45 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  23.53 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  27.64 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  27.15 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  25.91 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  30.19 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  29.44 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  22.57 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  29.84 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.97 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  27.13 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  29.45 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  27.02 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  29.09 
 
 		 317 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  28.8 
 
 		 312 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  29.03 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  28.4 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  27.52 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  26.94 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  25.37 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  28.85 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  23.5 
 
 		 246 aa  48.9  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  26.38 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  28.47 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  25.73 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  25.3 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  28.24 
 
 		 270 aa  45.4  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  23.48 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  29.65 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  27.8 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  28.08 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  25.97 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  23.98 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  29.34 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  27.4 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  30.04 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  28.27 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  25.66 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  26.7 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  29.37 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  26.89 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  22.44 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>