More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4021 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 471 aa  964    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 471 aa  561  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 471 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  57.17 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 480 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 459 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 488 aa  501  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 474 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 477 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 485 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 469 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  44.32 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 506 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 524 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 493 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 461 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  43.8 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 456 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 462 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 463 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 460 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 460 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 485 aa  362  9e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 485 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 465 aa  360  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>