91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3653 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3653  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 472 aa  924    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.042009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0849  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.74 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5685  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.91 
 
 		 476 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1622  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.94 
 
 		 487 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1611  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.52 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2635  putative 2-nitropropane dioxygenase  56.2 
 
 		 491 aa  490  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4298  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.29 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.64 
 
 		 475 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000796531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0981  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.14 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50353  predicted protein  44.66 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1446  putative 2-nitropropane dioxygenase  52.88 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00192568  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.61 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.13 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.52 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.73 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.13 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.84 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.52 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.52 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.66 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.3 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.3 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.3 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.3 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  26.3 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.35 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.3 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.3 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  24.42 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  24.01 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.77 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.2 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  21.83 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.22 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.35 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.87 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.74 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.44 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.5 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.23 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.54 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.97 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.58 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2188  putative 2-nitropropane dioxygenase  26.63 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000766761 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.3 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  24.74 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.94 
 
 		 373 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.44 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.05 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.7 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  26.99 
 
 		 396 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.77 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.9 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.81 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  21.74 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  23.62 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.02 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.37 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.63 
 
 		 417 aa  50.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.99 
 
 		 393 aa  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.07 
 
 		 366 aa  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  21.51 
 
 		 361 aa  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5061  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.53 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2694  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.84 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2391  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.84 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.93 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2896  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.84 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1705  2-nitropropane dioxygenase  25.84 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2815  2-nitropropane dioxygenase  25.54 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0622  hypothetical protein  25.54 
 
 		 405 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2751  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.54 
 
 		 405 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.77 
 
 		 345 aa  47.4  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  30.77 
 
 		 348 aa  47.8  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.78 
 
 		 316 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.38 
 
 		 340 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.97 
 
 		 365 aa  47  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.21 
 
 		 345 aa  46.6  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.46 
 
 		 338 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0455  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.06 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000961366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1803  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.84 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.54 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28.11 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1406  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.29 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00324657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.08 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.78 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  29.31 
 
 		 355 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.04 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  25 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.04 
 
 		 342 aa  44.3  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  21.04 
 
 		 363 aa  44.3  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.42 
 
 		 326 aa  43.5  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>