More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3517 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 		 465 aa  915    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  68.03 
 
 		 479 aa  606  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.26 
 
 		 464 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  64.06 
 
 		 491 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  62.86 
 
 		 463 aa  541  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  60.37 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.36 
 
 		 460 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  64.38 
 
 		 471 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  63.1 
 
 		 460 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  60.22 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  61.79 
 
 		 481 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  59.23 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  60 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  61.34 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  60.69 
 
 		 478 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  61.02 
 
 		 483 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  58.89 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  60.98 
 
 		 495 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  57.08 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  62.28 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  61.35 
 
 		 506 aa  501  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  57.59 
 
 		 491 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  57.02 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  56.81 
 
 		 470 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  57.02 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  61.11 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  57.76 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  60 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  58.55 
 
 		 476 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  57.14 
 
 		 471 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  56.1 
 
 		 495 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  57.51 
 
 		 467 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  62.39 
 
 		 463 aa  488  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  56.75 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  61.74 
 
 		 480 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  55.82 
 
 		 463 aa  481  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 		 470 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.6 
 
 		 459 aa  257  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 		 465 aa  242  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.42 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.43 
 
 		 465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.15 
 
 		 562 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.76 
 
 		 473 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 		 465 aa  233  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 		 463 aa  233  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 		 468 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.43 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.74 
 
 		 471 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.28 
 
 		 458 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.14 
 
 		 459 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.48 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.83 
 
 		 474 aa  227  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.55 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 		 468 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.99 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.22 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 		 462 aa  224  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 		 468 aa  223  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.8 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.57 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.55 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 467 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 		 469 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.55 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.18 
 
 		 471 aa  220  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.13 
 
 		 467 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 		 457 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 		 467 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 		 467 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.54 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.28 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.56 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.01 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>