275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2525 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
122 aa  239  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  59.78 
 
 
161 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.57 
 
 
166 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.51 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  56.98 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.79 
 
 
134 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.4 
 
 
207 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.74 
 
 
204 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.98 
 
 
192 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.62 
 
 
138 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  49.19 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.19 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.19 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.89 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  49.57 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.87 
 
 
128 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.83 
 
 
163 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  44.21 
 
 
142 aa  87.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  43.33 
 
 
141 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  47.62 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.73 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.95 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.13 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.28 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.82 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  41.07 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.96 
 
 
381 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  34.4 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  37.07 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.11 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  37.89 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.75 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.78 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.32 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  31.5 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
370 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38 
 
 
435 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  37.63 
 
 
181 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
512 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
508 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
513 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  43.02 
 
 
504 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 
508 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  36.56 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  39.39 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  36.96 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  35.16 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  46.67 
 
 
370 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  35.48 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 
508 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  30.69 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.67 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  41.67 
 
 
508 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  41.67 
 
 
508 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
186 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  42.31 
 
 
592 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  41.67 
 
 
508 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  41.67 
 
 
508 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.67 
 
 
508 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.88 
 
 
294 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.67 
 
 
508 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.67 
 
 
508 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 
227 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.41 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 
531 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  34.78 
 
 
181 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  43.55 
 
 
203 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  48.21 
 
 
349 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  36.67 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0893  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203676  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  41.67 
 
 
508 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.67 
 
 
508 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4136  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.38 
 
 
167 aa  53.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  47.06 
 
 
647 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  48.21 
 
 
504 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  47.06 
 
 
647 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.66 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  36.26 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.43 
 
 
349 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1673  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.18 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314946  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
520 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.75 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  44.64 
 
 
346 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 
526 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  35.56 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.1 
 
 
206 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 
374 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  46.43 
 
 
354 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.98 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  40.32 
 
 
207 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  38.96 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.91 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>