More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2076 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2076  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
169 aa  336  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1481  redoxin domain-containing protein  44.19 
 
 
191 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240767  decreased coverage  0.0000344314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11694  lipoprotein dsbF  37.43 
 
 
182 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.586251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1539  redoxin domain-containing protein  39.49 
 
 
193 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482949  normal  0.281635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12893  soluble secreted antigen mpt53 precursor  38.32 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4951  redoxin domain-containing protein  38.93 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654401  decreased coverage  0.00344255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.78 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.75 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13208  thiol:disulfide interchange protein  32.33 
 
 
369 aa  58.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.281994  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.27 
 
 
201 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.27 
 
 
194 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  31.14 
 
 
191 aa  57.4  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.75 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.03 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.98 
 
 
422 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  31.19 
 
 
109 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.27 
 
 
355 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  26.87 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.96 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4758  redoxin domain-containing protein  31.13 
 
 
204 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  30.25 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  35.85 
 
 
174 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0780  Redoxin domain protein  20.14 
 
 
471 aa  54.3  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.17 
 
 
178 aa  54.3  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  25.93 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3457  hypothetical protein  27.19 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  28.57 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  34.91 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.53 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 
199 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  42.42 
 
 
209 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  29.79 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.82 
 
 
715 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.07 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0994  hypothetical protein  22.73 
 
 
311 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  34.78 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.97 
 
 
200 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  26.12 
 
 
173 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28.97 
 
 
165 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0836  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 
202 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  unclonable  0.000000000312074 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  32.08 
 
 
174 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  36.67 
 
 
193 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 
189 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  31.82 
 
 
220 aa  51.2  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  36.46 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  25.86 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.31 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  38.71 
 
 
406 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  32.41 
 
 
266 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  28.79 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  28.79 
 
 
396 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  28.04 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.05 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  39.66 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  42.11 
 
 
107 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  24.22 
 
 
363 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  34.09 
 
 
107 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.87 
 
 
493 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.71 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.68 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  40.35 
 
 
107 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4526  Redoxin domain protein  27.96 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.18301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  28.23 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  38.6 
 
 
107 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.03 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  29.7 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  37.7 
 
 
109 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  24.18 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  35.29 
 
 
182 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  28.45 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.26 
 
 
201 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  36 
 
 
123 aa  48.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.56 
 
 
390 aa  48.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  23.77 
 
 
403 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3992  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.87 
 
 
376 aa  48.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.984971  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  37.7 
 
 
109 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1354  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.64 
 
 
372 aa  48.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.81 
 
 
187 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  23.77 
 
 
403 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  26.47 
 
 
167 aa  47.8  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  29.09 
 
 
187 aa  47.8  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.78 
 
 
192 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.66 
 
 
376 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
193 aa  47.8  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  36.54 
 
 
109 aa  47.8  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.82 
 
 
447 aa  47.4  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4982  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.06 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  22.63 
 
 
184 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  22.63 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  22.63 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  34.48 
 
 
139 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  34.48 
 
 
139 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  31.25 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  40.82 
 
 
109 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  34.48 
 
 
139 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3993  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.21 
 
 
378 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  25.87 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  25.95 
 
 
175 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>