253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1523 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1523  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  339  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  66.04 
 
 
213 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8351  metal-dependent hydrolase-like protein  65.41 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3802  protein of unknown function DUF45  63.69 
 
 
191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27520  predicted metal-dependent hydrolase  60.38 
 
 
203 aa  191  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7934  protein of unknown function DUF45  62.26 
 
 
180 aa  190  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1185  protein of unknown function DUF45  60.67 
 
 
258 aa  187  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.149779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3736  protein of unknown function DUF45  62.89 
 
 
174 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  63.01 
 
 
173 aa  184  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  59.39 
 
 
201 aa  178  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  59.44 
 
 
236 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4114  hypothetical protein  61.81 
 
 
172 aa  175  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26654  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3733  hypothetical protein  60.42 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.586168  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0790  protein of unknown function DUF45  65.58 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  59.39 
 
 
175 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0533  metal-dependent hydrolase  54.66 
 
 
210 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  59.51 
 
 
241 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0720  protein of unknown function DUF45  52.78 
 
 
206 aa  164  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4380  hypothetical protein  58.67 
 
 
178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  59.72 
 
 
208 aa  160  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11430  predicted metal-dependent hydrolase  53.15 
 
 
220 aa  147  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0278  hypothetical protein  43.12 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2474  protein of unknown function DUF45  45.75 
 
 
211 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000651268 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19100  predicted metal-dependent hydrolase  49.35 
 
 
198 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.155698  normal  0.193452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2752  hypothetical protein  47.37 
 
 
211 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15040  predicted metal-dependent hydrolase  46.11 
 
 
222 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  45.71 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  44.29 
 
 
227 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  47.14 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  50 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  43.66 
 
 
236 aa  64.3  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  36.97 
 
 
249 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3318  hypothetical protein  40.96 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  36.36 
 
 
223 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  43.33 
 
 
238 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  44.44 
 
 
240 aa  62.4  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  38.18 
 
 
238 aa  62  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  27.61 
 
 
481 aa  62  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  33.87 
 
 
279 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  29.91 
 
 
241 aa  61.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  42.31 
 
 
239 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  33.61 
 
 
184 aa  61.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  37.82 
 
 
278 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  47.46 
 
 
259 aa  61.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  30.3 
 
 
232 aa  60.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  40 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  50.88 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  45.61 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  44.16 
 
 
268 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  45.76 
 
 
249 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  40.68 
 
 
252 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  32.89 
 
 
226 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  36.9 
 
 
262 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  37.33 
 
 
220 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  42.42 
 
 
245 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  47.37 
 
 
240 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  44 
 
 
227 aa  58.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  41.18 
 
 
288 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  42.11 
 
 
239 aa  58.2  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  38.55 
 
 
238 aa  57.8  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  43.06 
 
 
268 aa  57.8  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  35.8 
 
 
235 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  57.4  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  34.94 
 
 
243 aa  57.4  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  29.03 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  39.76 
 
 
292 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  35.06 
 
 
235 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  39.76 
 
 
292 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  39.76 
 
 
292 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  38.55 
 
 
316 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  39.76 
 
 
295 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  41.03 
 
 
224 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1624  hypothetical protein  26.52 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.594523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  39.76 
 
 
292 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  39.76 
 
 
303 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  40.68 
 
 
244 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  39.76 
 
 
292 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  42.86 
 
 
243 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  39.76 
 
 
292 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  41.03 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  39.76 
 
 
292 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  42.11 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  39.02 
 
 
261 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  40 
 
 
292 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  44.29 
 
 
270 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  38.98 
 
 
235 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  47.69 
 
 
286 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3889  hypothetical protein  39.44 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  30.46 
 
 
278 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  29.1 
 
 
242 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  38.55 
 
 
301 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  38.55 
 
 
295 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  44.29 
 
 
285 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  40 
 
 
229 aa  56.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  40 
 
 
292 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  27.96 
 
 
215 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  27.63 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>