31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0815 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  37.19 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  36.73 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  35.26 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  33.86 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  37.3 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  28.28 
 
 
230 aa  61.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  35.6 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  33.02 
 
 
260 aa  58.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  32.79 
 
 
222 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  33.88 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  35.91 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0413  hypothetical protein  32.99 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0431788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  34.62 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  30.86 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  35.11 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  35.11 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  38.02 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  40 
 
 
265 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  34.08 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  34.62 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  31.12 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  33.15 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0590  protein of unknown function DUF121  31.33 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.304416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  32.87 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  34.92 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  32.39 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  35.53 
 
 
214 aa  44.7  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  34.34 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  36.22 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  34.25 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>