More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2218 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0499  transposase  85.17 
 
 
450 aa  697    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  97.44 
 
 
427 aa  796    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  85.17 
 
 
392 aa  696    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  80.66 
 
 
393 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  100 
 
 
392 aa  818    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  96.4 
 
 
390 aa  781    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  87.98 
 
 
392 aa  723    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  76 
 
 
403 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  56.46 
 
 
393 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  57.11 
 
 
384 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1184  transposase IS605  57.32 
 
 
323 aa  335  9e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  44.16 
 
 
367 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  46.22 
 
 
381 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  43.87 
 
 
367 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  45.38 
 
 
408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  42.58 
 
 
381 aa  305  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  42.74 
 
 
416 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.44 
 
 
376 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.14 
 
 
381 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  44.04 
 
 
368 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  42.74 
 
 
373 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  41.8 
 
 
377 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  41.51 
 
 
383 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  42.27 
 
 
405 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  41.94 
 
 
403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  43.9 
 
 
381 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  41.6 
 
 
410 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  39.64 
 
 
403 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  39.64 
 
 
403 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  39.64 
 
 
403 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  39.64 
 
 
403 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  39.38 
 
 
403 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  41.6 
 
 
410 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  42.42 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  42.7 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40.47 
 
 
395 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  38.85 
 
 
390 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  42.27 
 
 
405 aa  269  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  40.44 
 
 
391 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  38.92 
 
 
404 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  41.71 
 
 
377 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  38.92 
 
 
404 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  40.94 
 
 
375 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  38.78 
 
 
391 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  38.06 
 
 
405 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  38.61 
 
 
384 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  41.16 
 
 
377 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  39.06 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  41.16 
 
 
377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  38.68 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  39.16 
 
 
417 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  39.17 
 
 
383 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  39.37 
 
 
396 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  38.54 
 
 
383 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  38.86 
 
 
394 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  38.86 
 
 
394 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  38.06 
 
 
383 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  38.06 
 
 
383 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  39.62 
 
 
405 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  39.62 
 
 
405 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  38.4 
 
 
383 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  38.4 
 
 
383 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  38.4 
 
 
383 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  38.4 
 
 
383 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  38.79 
 
 
424 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  39.39 
 
 
406 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.55 
 
 
461 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  38.42 
 
 
435 aa  245  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  37.43 
 
 
377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  38.83 
 
 
416 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  37.85 
 
 
383 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  36.39 
 
 
373 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  39.75 
 
 
425 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.27 
 
 
402 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  35.87 
 
 
382 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  36.1 
 
 
373 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  36.96 
 
 
394 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  35.66 
 
 
382 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  38.3 
 
 
402 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
370 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  35.56 
 
 
372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  34.31 
 
 
370 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  36.01 
 
 
397 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  35.56 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  36.01 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  35.56 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  35.56 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  35.29 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  35.28 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  34.75 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  35.56 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  35.56 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  35.56 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  36.13 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  36.13 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  36.13 
 
 
402 aa  233  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  35.01 
 
 
393 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  35.01 
 
 
370 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  33.87 
 
 
370 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  37.89 
 
 
383 aa  230  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>