More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1079 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
342 aa  714    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.95 
 
 
345 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 
338 aa  298  1e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.92 
 
 
342 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.04 
 
 
346 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
338 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
345 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3723  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.94 
 
 
349 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
349 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.7 
 
 
374 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.54 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.67 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.84 
 
 
348 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.68 
 
 
346 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.15 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.34 
 
 
329 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.91 
 
 
335 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0626  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.84 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122576  normal  0.0367599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.21 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
361 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.49 
 
 
336 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.81 
 
 
341 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.43 
 
 
346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  29.06 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.65 
 
 
367 aa  165  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.06 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
345 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
345 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.72 
 
 
341 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.54 
 
 
359 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
346 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.36 
 
 
356 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  29.18 
 
 
351 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  30.42 
 
 
359 aa  153  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.5 
 
 
338 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  28.57 
 
 
341 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.81 
 
 
366 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  29.55 
 
 
348 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
348 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.67 
 
 
347 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  28.16 
 
 
341 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.13 
 
 
346 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.22 
 
 
373 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
362 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
373 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  28.32 
 
 
355 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  27.87 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  26.94 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  27.87 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  27.87 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  28.32 
 
 
408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.94 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  27.38 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  27.87 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 
408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  30.03 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  27.87 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  27.87 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  26.94 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  28.45 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  28.45 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0075  sorbitol dehydrogenase, putative  28.74 
 
 
348 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.22 
 
 
341 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  28.45 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.05 
 
 
347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  28.16 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  26.67 
 
 
352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  27.53 
 
 
375 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  26.72 
 
 
341 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  28.16 
 
 
341 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.14 
 
 
347 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  26.72 
 
 
341 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  26.72 
 
 
341 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
341 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  26.19 
 
 
348 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.48 
 
 
346 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
341 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.87 
 
 
344 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
336 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  27.46 
 
 
343 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  30.06 
 
 
346 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  27.01 
 
 
341 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.68 
 
 
333 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.88 
 
 
339 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  27.03 
 
 
341 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
341 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  28.94 
 
 
361 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  26.61 
 
 
340 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>