24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0787 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1058    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  42.5 
 
 
569 aa  333  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  31.43 
 
 
637 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  27.18 
 
 
609 aa  187  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  33.05 
 
 
642 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  24.74 
 
 
449 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  24.58 
 
 
436 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  24.78 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  25.2 
 
 
431 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  21.21 
 
 
431 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  23.39 
 
 
430 aa  57  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  21.97 
 
 
824 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  26.83 
 
 
344 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  22.22 
 
 
467 aa  54.7  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  23.7 
 
 
437 aa  53.5  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  21.78 
 
 
380 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  22.33 
 
 
437 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  23.18 
 
 
432 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3171  S-layer-like domain-containing protein  21.57 
 
 
815 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.412777  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4247  hypothetical protein  26.39 
 
 
379 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  22.89 
 
 
352 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  22.71 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  24.06 
 
 
378 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  23.2 
 
 
354 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>