45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3670 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  58.78 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  48.76 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  41.18 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  44.53 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  47.11 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  46.34 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  34.75 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  36.52 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  35.83 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  32.52 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  30.33 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  34.43 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  31.5 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  29.51 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  31.47 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  29.41 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  29.84 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  26.23 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  30.41 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  28.03 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  33.62 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  31.25 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  31.9 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  28.38 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  33.33 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  28.57 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  28.23 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  27.19 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  29.75 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  32.91 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  25.21 
 
 		 246 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  26.35 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  28.7 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  26.27 
 
 		 270 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  28.03 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  28.07 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  25.83 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  24.17 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  26.89 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  31.47 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  29.06 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  25.16 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>