More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2369 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2369  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
770 aa  1570    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
1241 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
1241 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
1261 aa  122  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
1089 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  22.02 
 
 
1915 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
1398 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
1229 aa  110  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
1028 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
838 aa  108  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
381 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1614  hypothetical protein  23.04 
 
 
478 aa  104  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0795307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
831 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  26.06 
 
 
1232 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  30.31 
 
 
1219 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
364 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
373 aa  99.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
364 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
423 aa  95.9  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
360 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
370 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
846 aa  95.5  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  28.67 
 
 
859 aa  95.1  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
967 aa  94.7  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
860 aa  94.7  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  30.19 
 
 
846 aa  94  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
382 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1975  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
763 aa  93.2  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.422047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
361 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
369 aa  91.7  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
378 aa  91.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.28 
 
 
364 aa  91.3  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
370 aa  91.3  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
376 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
370 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.85 
 
 
351 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
381 aa  88.2  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
371 aa  87.8  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
361 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
366 aa  87  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
355 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
435 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
382 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
420 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
850 aa  85.9  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  26.94 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
381 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
380 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
395 aa  83.2  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.64 
 
 
815 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  24.1 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  24.63 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
434 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  24.63 
 
 
375 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
464 aa  80.5  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
343 aa  79.7  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
435 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
366 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  27.51 
 
 
373 aa  79.7  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.86 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  22.76 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
357 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
371 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  25.54 
 
 
354 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
368 aa  73.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  25.22 
 
 
354 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  27.5 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
392 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 
1243 aa  71.2  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  23.62 
 
 
430 aa  70.1  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>