35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2241 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  354  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  79.55 
 
 		 179 aa  275  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  73.99 
 
 		 181 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  70.17 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  70.22 
 
 		 185 aa  253  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  70.39 
 
 		 175 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  67.4 
 
 		 180 aa  250  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  56.05 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  41.67 
 
 		 152 aa  111  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  42.86 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  45 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  40.29 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  42.75 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  43.24 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  41.89 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  42.75 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  42.75 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  38.69 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  35.15 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  38.85 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  32.53 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  38.52 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  30.72 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  30.72 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  38.89 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  32.65 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  31.95 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  31.76 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  31.08 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  31.76 
 
 		 150 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  32.32 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  31.54 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  26.97 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  30.67 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  25.71 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>