More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0808 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 342 aa  688    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  97.95 
 
 		 342 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  68.91 
 
 		 341 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  67.74 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.37 
 
 		 348 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.67 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.82 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.77 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.77 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.77 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.77 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  59.12 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.32 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.14 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  48.53 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  48.53 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  48.24 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  48.53 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  48.53 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  48.53 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  48.53 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.12 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  48.25 
 
 		 343 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  49.7 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  48.97 
 
 		 343 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.98 
 
 		 338 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0464  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.98 
 
 		 332 aa  321  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.96 
 
 		 337 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  48.35 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  48.35 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  47.92 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  47.92 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  47.92 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  47.62 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  47.62 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  47.62 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.41 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  49.41 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1999  transposase IS116/IS110/IS902  46.41 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3769  transposase IS116/IS110/IS902  46.41 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.06 
 
 		 344 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.35 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.4 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.9 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.32 
 
 		 315 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  44.44 
 
 		 385 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.01 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.01 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  45.45 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 		 343 aa  278  7e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 		 343 aa  278  7e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  42.09 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  42.06 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  42.09 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  50 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  50 
 
 		 285 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.28 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 350 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3274  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  42.22 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  42.94 
 
 		 340 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  42.27 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.27 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.27 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.27 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.27 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.27 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  41.89 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  41.42 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  41.42 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41 
 
 		 338 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  43.2 
 
 		 343 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41 
 
 		 338 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41 
 
 		 338 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>