More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4914 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 266 aa  534  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  79.54 
 
 		 265 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1150  phosphomethylpyrimidine kinase  75.76 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0407  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2795  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  72.2 
 
 		 283 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0136558  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0186  phosphomethylpyrimidine kinase  70.66 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2928  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  69.88 
 
 		 263 aa  351  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30100  phosphomethylpyrimidine kinase  64.09 
 
 		 266 aa  330  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0721  phosphomethylpyrimidine kinase  62.69 
 
 		 285 aa  311  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0593  phosphomethylpyrimidine kinase  61.22 
 
 		 280 aa  308  8e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03020  phosphomethylpyrimidine kinase  59.84 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  45.9 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  45.9 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  45.9 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  45.9 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  45.9 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  45.9 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  45.9 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  45.9 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  45.9 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  45.53 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  45.53 
 
 		 273 aa  228  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  46.12 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  46.94 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  43.27 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  42.45 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0226  phosphomethylpyrimidine kinase  40.82 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  43.23 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.23 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  41.74 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.23 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.74 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  37.8 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0693  phosphomethylpyrimidine kinase  41.05 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  34.57 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  39.37 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  39.53 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  39.53 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  42.45 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  41.53 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  35.09 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  37.93 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  39.52 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.74 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  40.32 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  38.98 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  32.4 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0101  phosphomethylpyrimidine kinase  32.68 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 436 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  41.94 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  37.01 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  37.77 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1271  phosphomethylpyrimidine kinase  38.13 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000051939  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0750  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  38.35 
 
 		 449 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  38.68 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  39.91 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  43.67 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  37.07 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  35.22 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  34.31 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  39.59 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 		 490 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  37.64 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  34.29 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  34.29 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  39.36 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  39.04 
 
 		 497 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  38.34 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  39.53 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  38.06 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  38.89 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  36.24 
 
 		 492 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3672  phosphomethylpyrimidine kinase  42.45 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal  0.238942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>