More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5094 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
570 aa  1120    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  58.79 
 
 
554 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.94 
 
 
525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  50.1 
 
 
531 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  50.1 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.65 
 
 
512 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  44.12 
 
 
534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.26 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.03 
 
 
531 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  46.72 
 
 
524 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.17 
 
 
505 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.78 
 
 
515 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.49 
 
 
505 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  46.13 
 
 
546 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  48.84 
 
 
531 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.74 
 
 
509 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  58.28 
 
 
523 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.38 
 
 
545 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.72 
 
 
508 aa  356  5.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  43.13 
 
 
542 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  56.53 
 
 
512 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.53 
 
 
512 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.53 
 
 
512 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.89 
 
 
520 aa  350  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.28 
 
 
521 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  53.87 
 
 
538 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.13 
 
 
532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  43.25 
 
 
488 aa  333  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.54 
 
 
508 aa  302  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  49.85 
 
 
608 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.74 
 
 
552 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  44.67 
 
 
501 aa  261  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.98 
 
 
501 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  34.92 
 
 
505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  37.29 
 
 
528 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  36.08 
 
 
489 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.64 
 
 
512 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.59 
 
 
465 aa  167  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
415 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  33.77 
 
 
372 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  34.11 
 
 
369 aa  120  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.98 
 
 
376 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  29.9 
 
 
403 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.2 
 
 
414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.1 
 
 
400 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.59 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  30.39 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  29.33 
 
 
429 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  32.48 
 
 
407 aa  112  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  29.23 
 
 
369 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.41 
 
 
335 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  30.97 
 
 
414 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  27.57 
 
 
412 aa  110  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.91 
 
 
402 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
401 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  38.32 
 
 
231 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.76 
 
 
200 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.98 
 
 
446 aa  104  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  31.29 
 
 
405 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  31.29 
 
 
405 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  27.81 
 
 
431 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  30.87 
 
 
406 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  37.13 
 
 
231 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.07 
 
 
400 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  37.13 
 
 
231 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  32.14 
 
 
403 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  27.86 
 
 
369 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.87 
 
 
402 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.98 
 
 
209 aa  100  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 
402 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.52 
 
 
420 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  32.72 
 
 
230 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 
426 aa  99.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.81 
 
 
199 aa  98.6  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  25.36 
 
 
445 aa  98.2  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30.09 
 
 
409 aa  98.6  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  28.65 
 
 
229 aa  97.8  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 
270 aa  97.8  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.89 
 
 
221 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.26 
 
 
412 aa  97.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.48 
 
 
415 aa  97.1  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  30.09 
 
 
424 aa  96.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  29.27 
 
 
309 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.96 
 
 
237 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  32.23 
 
 
349 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.72 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.69 
 
 
402 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  25.62 
 
 
414 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  28.96 
 
 
338 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  32.58 
 
 
361 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.81 
 
 
401 aa  94  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  32.22 
 
 
228 aa  94  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  29.55 
 
 
414 aa  93.6  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.58 
 
 
406 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.44 
 
 
407 aa  93.6  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.37 
 
 
408 aa  93.2  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  26.59 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.3 
 
 
410 aa  92.8  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.49 
 
 
418 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  27.78 
 
 
428 aa  92.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>