173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4453 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
314 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  55.12 
 
 
337 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  54.49 
 
 
312 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  46.69 
 
 
642 aa  228  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  45.36 
 
 
323 aa  205  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  44.64 
 
 
323 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
326 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
326 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 
328 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 
309 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 
317 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
302 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  35.95 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
305 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  29.05 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  33.86 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  30.92 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
326 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  43.36 
 
 
454 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.47 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.47 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  35.76 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.81 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.86 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.86 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  22.59 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  28.22 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  28.7 
 
 
310 aa  59.3  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  29.86 
 
 
1066 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  21.52 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  21.85 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  26.84 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
598 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.45 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
325 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  31.9 
 
 
281 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
413 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 
345 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
310 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  26.76 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  22.59 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
924 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  31.4 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.74 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
438 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  41.57 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  29.93 
 
 
295 aa  49.7  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  25.74 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
240 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.41 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.41 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.41 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.41 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>