126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4350 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4350  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
205 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1328  hypothetical protein  51.85 
 
 
192 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.35673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  43.17 
 
 
173 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7216  NADPH-dependent FMN reductase  44.57 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  43.89 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  45.09 
 
 
170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  46.39 
 
 
170 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2918  NADPH-dependent FMN reductase  42.93 
 
 
189 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148799  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1978  NADPH-dependent FMN reductase  42.59 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.789371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0427  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
184 aa  99  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  44.3 
 
 
153 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4988  NADPH-dependent FMN reductase  44.3 
 
 
153 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  40.98 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5267  NADPH-dependent FMN reductase  44.3 
 
 
153 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4209  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
160 aa  88.6  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  35.18 
 
 
207 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3775  NADPH-dependent FMN reductase  41.99 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.436385  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  35.18 
 
 
207 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  46.53 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  37.07 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  46.94 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  43.88 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  48.1 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  34.74 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  43.53 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.99 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.43 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
197 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.43 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  33.79 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2472  flavoprotein  43.18 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  50.82 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.85 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  30.34 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  33.58 
 
 
224 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
190 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  38.46 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  42.67 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  38.46 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3713  NADPH-dependent FMN reductase  34.45 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.63 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  39.29 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  32.86 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
177 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.33 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  30.66 
 
 
190 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  30.46 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  33.8 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2790  NADPH-dependent FMN reductase  29.24 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  30.88 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  30.66 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  31.94 
 
 
193 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  28.67 
 
 
176 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 
195 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
185 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26140  predicted flavoprotein  36.9 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.744413  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  39.19 
 
 
187 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  33.1 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  26.67 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  28.97 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  34.81 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  28.17 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  39.19 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  31.08 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  30.14 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  26.67 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  32.17 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  32.17 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  39.39 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  33.77 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  28.17 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  41.54 
 
 
189 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
181 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>