More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4183 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
362 aa  700    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  52.14 
 
 
379 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  45.65 
 
 
395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  49.18 
 
 
354 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  50.19 
 
 
471 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  40.66 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
398 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  36.34 
 
 
364 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  35.24 
 
 
361 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 
370 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 
376 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
374 aa  126  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
370 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  35.14 
 
 
346 aa  122  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
346 aa  122  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
358 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 
364 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  37.09 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
394 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
420 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  31.27 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.91 
 
 
375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  35.31 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
373 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
371 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
464 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
434 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  33.21 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
370 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
428 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
382 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
378 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  28.74 
 
 
372 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  28.4 
 
 
372 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  29.82 
 
 
381 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.51 
 
 
361 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
381 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
384 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
370 aa  106  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
417 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0743  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
354 aa  106  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0554251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
378 aa  105  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
437 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  32.04 
 
 
859 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
377 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
371 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
860 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
397 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
384 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
385 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
369 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
380 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
343 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27 
 
 
351 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
423 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
381 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
380 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
376 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  29.28 
 
 
337 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  35.99 
 
 
373 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
435 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  29.28 
 
 
337 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
376 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  29.37 
 
 
374 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
376 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
381 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
381 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
373 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
366 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
365 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.08 
 
 
430 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.91 
 
 
374 aa  99.4  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  25.82 
 
 
364 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
343 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
389 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>