More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3165 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  100 
 
 
538 aa  1025    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  60.4 
 
 
538 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  60.07 
 
 
557 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  52.35 
 
 
863 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  54.32 
 
 
847 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  52.24 
 
 
545 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  51.94 
 
 
558 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  50.55 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  52.47 
 
 
519 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  49.15 
 
 
867 aa  405  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  48.38 
 
 
577 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  52.86 
 
 
514 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  52.15 
 
 
548 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  52.15 
 
 
548 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  51.95 
 
 
535 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  46.98 
 
 
557 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  50.9 
 
 
548 aa  395  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  49.82 
 
 
566 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  51.47 
 
 
872 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  50.95 
 
 
527 aa  382  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  49.43 
 
 
575 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  48.81 
 
 
572 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  48.03 
 
 
572 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  48.78 
 
 
549 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  44.55 
 
 
507 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  53.42 
 
 
533 aa  362  7.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
542 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 
534 aa  362  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  43.62 
 
 
533 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  49.82 
 
 
572 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  43.5 
 
 
545 aa  349  9e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  47.3 
 
 
589 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  40.63 
 
 
531 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  43.77 
 
 
535 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  39.78 
 
 
531 aa  346  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 
522 aa  346  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  42 
 
 
579 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  45.35 
 
 
529 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  45.35 
 
 
529 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  41.81 
 
 
528 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  38.97 
 
 
532 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 
532 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
532 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  38.29 
 
 
532 aa  341  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  43.9 
 
 
538 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  43.12 
 
 
535 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  43.12 
 
 
535 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2011  L-aspartate oxidase  50.8 
 
 
482 aa  340  5e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  42 
 
 
534 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  43.88 
 
 
535 aa  339  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  38.45 
 
 
531 aa  338  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  41.04 
 
 
515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  41.07 
 
 
556 aa  337  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  40.81 
 
 
565 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 
534 aa  336  7e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  42.59 
 
 
529 aa  336  7.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  41.29 
 
 
533 aa  335  9e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  41.4 
 
 
609 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 
515 aa  335  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 
533 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  38.12 
 
 
509 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  43.87 
 
 
533 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  44.09 
 
 
502 aa  333  6e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  43.55 
 
 
532 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  38.89 
 
 
531 aa  332  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  37.16 
 
 
509 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  37.16 
 
 
509 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  44.25 
 
 
533 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  45.07 
 
 
541 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  40.34 
 
 
531 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  39.02 
 
 
531 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  42.77 
 
 
532 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  37.16 
 
 
509 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  43.08 
 
 
532 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  38.24 
 
 
509 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  37.86 
 
 
509 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  37.86 
 
 
509 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 
541 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  42.4 
 
 
541 aa  329  6e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  44.11 
 
 
534 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  44.91 
 
 
527 aa  329  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  38.78 
 
 
531 aa  329  7e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  38.42 
 
 
519 aa  329  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  38.01 
 
 
528 aa  329  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  38.26 
 
 
531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  39.29 
 
 
533 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  39.46 
 
 
516 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  40.52 
 
 
571 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  37.67 
 
 
509 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 
532 aa  325  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  38.61 
 
 
538 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 
570 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 
570 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 
570 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 
570 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 
570 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  40.56 
 
 
542 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 
535 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  38 
 
 
537 aa  323  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  40.51 
 
 
534 aa  323  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>