40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1256 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  100 
 
 		 125 aa  246  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  55.29 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  54.55 
 
 		 96 aa  86.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  52.86 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  52.86 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  52.86 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  49.37 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  47.37 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  52.31 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  47.62 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  39 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  50 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  43.01 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  46.05 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  33.33 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  38.16 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  38.16 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  41.94 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  32.99 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  38.57 
 
 		 359 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.67 
 
 		 381 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  39.62 
 
 		 385 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  43.33 
 
 		 371 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  36.11 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.93 
 
 		 358 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35 
 
 		 358 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.18 
 
 		 375 aa  42  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  36.07 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  37.7 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  36.67 
 
 		 366 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  38.71 
 
 		 108 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.98 
 
 		 384 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  38.33 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.33 
 
 		 358 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  36.07 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  36.07 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.79 
 
 		 371 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  31.67 
 
 		 373 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  28.79 
 
 		 371 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  29.69 
 
 		 366 aa  40  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>