More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0213 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0213  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
330 aa  682    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.354615  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
332 aa  285  5.999999999999999e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
338 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0167  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
333 aa  275  6e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0110  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
336 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
338 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
327 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
338 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
355 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
337 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
337 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
335 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
347 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
336 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
336 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
337 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
344 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
349 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
348 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
337 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
350 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  44 
 
 
337 aa  258  9e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
341 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
331 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
356 aa  255  6e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
347 aa  255  7e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
335 aa  252  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
347 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
335 aa  251  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
355 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
345 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
355 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
355 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
344 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
353 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
355 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
337 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
350 aa  245  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
328 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
357 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
357 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
347 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
332 aa  242  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  39.49 
 
 
360 aa  241  9e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
328 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
347 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
344 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
329 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
335 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  39.47 
 
 
342 aa  239  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
353 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
353 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
354 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
329 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
341 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
345 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
329 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
329 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
329 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
347 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
347 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
337 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
339 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
329 aa  235  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
330 aa  235  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
347 aa  235  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
329 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
348 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
354 aa  232  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  43 
 
 
336 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
332 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
354 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
332 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
333 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
334 aa  229  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
336 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
332 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
360 aa  228  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
339 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
337 aa  225  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
327 aa  225  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
334 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
331 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
332 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
332 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
332 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>