33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1558 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1558  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  56.63 
 
 
206 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  56.63 
 
 
206 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  57.14 
 
 
206 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  52.04 
 
 
230 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  51.55 
 
 
193 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  46.04 
 
 
202 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  31.82 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  32.75 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  29.73 
 
 
194 aa  61.6  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  27.98 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  29.69 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  26.6 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  28.26 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  28.42 
 
 
196 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  26.14 
 
 
202 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  29.17 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  27.41 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  29.02 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  27.46 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  29.79 
 
 
207 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  27.67 
 
 
186 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  26.37 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  27.41 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  27.93 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  27.15 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  29.21 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  27.27 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  27.37 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  33.94 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  32.8 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  29.93 
 
 
189 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>